1. 孟德爾隨機化方法 傳統(tǒng)觀察性流行病學研究在發(fā)現(xiàn)疾病病因以及因果推斷中存在諸多挑戰(zhàn)，比如反向因果關聯(lián)、潛在混雜因素、微效暴露因素以及多重檢驗等，當研究者訴諸于隨機對照試驗...
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孟德爾隨機化推斷暴露因素與健康結局的因果關系 -
文獻學習096--Dynamics of Cardiac Neutrophil Diversity in Murine Myocardial Infarction1. Time-Dependent Transcriptional Heterogeneity of Neutrophils in the Infarcted Heart 作...
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文獻學習084--組織原位CCR2+巨噬細胞通過TLR9/MyD88/CXCL5 signaling促進neutrophil extravasation為了探究心肌缺血灌注損傷時調控中性粒細胞trafficking的upstream signals，作者使用了小鼠心臟移植模型（An essential advantage o...
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文獻學習088--組織原位巨噬細胞通過SR A1-c Myc軸減輕阿霉素誘導的心肌病通訊作者： 1. Both Monocyte-Derived and Resident Macrophages Participate in DiCM Development...
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我是外科醫(yī)生，所以很粗暴的喲！～～<br>歡迎大家關注微博“醫(yī)學小蛋散”哦～<br>讓學醫(yī)快樂～ <br>記錄行醫(yī)之旅～
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計算特定細胞群對疾病狀態(tài)的貢獻度在單細胞測序揭示心梗后的心臟免疫動態(tài)變化[http://www.itdecent.cn/p/c5043790077a]中，作者對MI不同時間點的小鼠心臟組織進行了單細胞測序...
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髓系細胞工具鼠匯總
一、巨噬細胞 1. Cre工具鼠 Cre工具鼠是通過在小鼠marker基因位點敲入Cre/CreERT2或者Dre/DreERT2元件構建而成。Cre工具鼠跟特定的flox小...
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CyTOF分析流程（一）：基于R語言的CyTOF數(shù)據(jù)預處理小魚爸 2023-08-03 簡介 質譜流式(Mass cytometry，CyTOF)得到越來越多的應用，適合用于深入表征健康和疾病組織異質性。目前，原始文件的預處理通常是...
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當紅辣子雞-空間轉錄組與單細胞轉錄組的整合分析（下篇）
作者：堯小飛審稿：童蒙編輯：amethyst SPOTlight SPOTlight 的目標是提供一種工具，能夠對包含細胞混合物的每個捕獲位置中存在的細胞類型和細胞類型比例進...
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logfc有區(qū)別，presto算的幾何平均值，findallmarkers計算的算數(shù)平均值
單細胞之富集分析-1：單細胞GSEA分析流程
單細胞GSEA分析需要的文件有兩個：1. 單細胞基因表達變化數(shù)據(jù)（兩列，一列是geneid/gene symbol，一列是logFC）（文件格式：.rnk）2. 目標基因集（...
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T細胞接受抗原刺激后的五個階段及其表型看到簡書上 小牛學生信 老師的筆記，也來源于流式中文網(wǎng)，很不錯，mark一下 2022-11-08 T細胞表征 - 簡書[https://www2.jianshu.com/p...
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文獻學習074--[sc]T cells specific for α-myosin drive immunotherapy-related myocarditis在此前的研究中，作者報道了一個ICI-MC小鼠模型，在這篇文章里，作者用的也是這個模型。 1. Cardiac clonal CD8+ T cells are abundan...
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文獻學習094--自我更新的心臟組織原位巨噬細胞限制心梗后的adverse remodeling1. Single-cell analyses show unique cardiac macrophage subsets. Fig 1a： 對心臟CD45+CD64+CD...
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文獻學習095--心臟原位巨噬細胞來源的Legumain通過促進心肌梗死后凋亡心肌細胞的清除和降解來改善心臟修復1. Lgmn Expression Increases After MI in Mice 為了確定參與endocytosis 和 intracellular traffic...
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不看私信<br>看不到的文章是被簡書鎖了
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文章復現(xiàn) | WGCNA算法識別腎透明細胞癌CD8T細胞浸潤相關關鍵基因前言：加權基因共表達網(wǎng)絡分析（weighted gene co-expression network analysis，WGCNA）是研究相似基因表達模式的一種方法，通過尋找...
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TIMER20和cibersort一個既能分析測序數(shù)據(jù)（最好是TPM格式），又能分析芯片數(shù)據(jù)的網(wǎng)站細胞免疫浸潤網(wǎng)站使用 1.cibersort 數(shù)據(jù)輸入格式：輸入數(shù)據(jù)的要求： 1.不可以有負值和缺失值 2.不要取log 3.如果是芯片數(shù)據(jù)，昂飛芯片使用RMA標準化，Ill...
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學習小組Day2筆記--知未1.什么是linux，什么是服務器？ ??linux是個操作系統(tǒng)，它開源、免費、穩(wěn)定、安全...優(yōu)點多多~ 主要作為服務器使用，支持多用戶同時使用且相互獨立，文件系統(tǒng)為樹狀結...
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