1. 孟德?tīng)栯S機(jī)化方法 傳統(tǒng)觀察性流行病學(xué)研究在發(fā)現(xiàn)疾病病因以及因果推斷中存在諸多挑戰(zhàn)，比如反向因果關(guān)聯(lián)、潛在混雜因素、微效暴露因素以及多重檢驗(yàn)等，當(dāng)研究者訴諸于隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：天津
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孟德?tīng)栯S機(jī)化推斷暴露因素與健康結(jié)局的因果關(guān)系 -
文獻(xiàn)學(xué)習(xí)096--Dynamics of Cardiac Neutrophil Diversity in Murine Myocardial Infarction1. Time-Dependent Transcriptional Heterogeneity of Neutrophils in the Infarcted Heart 作...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)084--組織原位CCR2+巨噬細(xì)胞通過(guò)TLR9/MyD88/CXCL5 signaling促進(jìn)neutrophil extravasation為了探究心肌缺血灌注損傷時(shí)調(diào)控中性粒細(xì)胞trafficking的upstream signals，作者使用了小鼠心臟移植模型（An essential advantage o...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)088--組織原位巨噬細(xì)胞通過(guò)SR A1-c Myc軸減輕阿霉素誘導(dǎo)的心肌病通訊作者： 1. Both Monocyte-Derived and Resident Macrophages Participate in DiCM Development...
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我是外科醫(yī)生，所以很粗暴的喲！～～<br>歡迎大家關(guān)注微博“醫(yī)學(xué)小蛋散”哦～<br>讓學(xué)醫(yī)快樂(lè)～ <br>記錄行醫(yī)之旅～
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計(jì)算特定細(xì)胞群對(duì)疾病狀態(tài)的貢獻(xiàn)度在單細(xì)胞測(cè)序揭示心梗后的心臟免疫動(dòng)態(tài)變化[http://www.itdecent.cn/p/c5043790077a]中，作者對(duì)MI不同時(shí)間點(diǎn)的小鼠心臟組織進(jìn)行了單細(xì)胞測(cè)序...
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髓系細(xì)胞工具鼠匯總
一、巨噬細(xì)胞 1. Cre工具鼠 Cre工具鼠是通過(guò)在小鼠marker基因位點(diǎn)敲入Cre/CreERT2或者Dre/DreERT2元件構(gòu)建而成。Cre工具鼠跟特定的flox小...
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CyTOF分析流程（一）：基于R語(yǔ)言的CyTOF數(shù)據(jù)預(yù)處理小魚爸 2023-08-03 簡(jiǎn)介 質(zhì)譜流式(Mass cytometry，CyTOF)得到越來(lái)越多的應(yīng)用，適合用于深入表征健康和疾病組織異質(zhì)性。目前，原始文件的預(yù)處理通常是...
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當(dāng)紅辣子雞-空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的整合分析（下篇）
作者：堯小飛審稿：童蒙編輯：amethyst SPOTlight SPOTlight 的目標(biāo)是提供一種工具，能夠?qū)Π?xì)胞混合物的每個(gè)捕獲位置中存在的細(xì)胞類型和細(xì)胞類型比例進(jìn)...
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logfc有區(qū)別，presto算的幾何平均值，findallmarkers計(jì)算的算數(shù)平均值
單細(xì)胞之富集分析-1：?jiǎn)渭?xì)胞GSEA分析流程
單細(xì)胞GSEA分析需要的文件有兩個(gè)：1. 單細(xì)胞基因表達(dá)變化數(shù)據(jù)（兩列，一列是geneid/gene symbol，一列是logFC）（文件格式：.rnk）2. 目標(biāo)基因集（...
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T細(xì)胞接受抗原刺激后的五個(gè)階段及其表型看到簡(jiǎn)書上 小牛學(xué)生信 老師的筆記，也來(lái)源于流式中文網(wǎng)，很不錯(cuò)，mark一下 2022-11-08 T細(xì)胞表征 - 簡(jiǎn)書[https://www2.jianshu.com/p...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)074--[sc]T cells specific for α-myosin drive immunotherapy-related myocarditis在此前的研究中，作者報(bào)道了一個(gè)ICI-MC小鼠模型，在這篇文章里，作者用的也是這個(gè)模型。 1. Cardiac clonal CD8+ T cells are abundan...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)094--自我更新的心臟組織原位巨噬細(xì)胞限制心梗后的adverse remodeling1. Single-cell analyses show unique cardiac macrophage subsets. Fig 1a： 對(duì)心臟CD45+CD64+CD...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)095--心臟原位巨噬細(xì)胞來(lái)源的Legumain通過(guò)促進(jìn)心肌梗死后凋亡心肌細(xì)胞的清除和降解來(lái)改善心臟修復(fù)1. Lgmn Expression Increases After MI in Mice 為了確定參與endocytosis 和 intracellular traffic...
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不看私信<br>看不到的文章是被簡(jiǎn)書鎖了
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文章復(fù)現(xiàn) | WGCNA算法識(shí)別腎透明細(xì)胞癌CD8T細(xì)胞浸潤(rùn)相關(guān)關(guān)鍵基因前言：加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（weighted gene co-expression network analysis，WGCNA）是研究相似基因表達(dá)模式的一種方法，通過(guò)尋找...
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TIMER20和cibersort一個(gè)既能分析測(cè)序數(shù)據(jù)（最好是TPM格式），又能分析芯片數(shù)據(jù)的網(wǎng)站細(xì)胞免疫浸潤(rùn)網(wǎng)站使用 1.cibersort 數(shù)據(jù)輸入格式：輸入數(shù)據(jù)的要求： 1.不可以有負(fù)值和缺失值 2.不要取log 3.如果是芯片數(shù)據(jù)，昂飛芯片使用RMA標(biāo)準(zhǔn)化，Ill...
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學(xué)習(xí)小組Day2筆記--知未1.什么是linux，什么是服務(wù)器？ ??linux是個(gè)操作系統(tǒng)，它開(kāi)源、免費(fèi)、穩(wěn)定、安全...優(yōu)點(diǎn)多多~ 主要作為服務(wù)器使用，支持多用戶同時(shí)使用且相互獨(dú)立，文件系統(tǒng)為樹(shù)狀結(jié)...
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