我的aspera密碼,我怎么沒印象我有這個密碼呢?能給解釋一下嗎
2020-09-29 使用Aspera從EBI或NCBI下載基因組數(shù)據(jù)來源:https://www.plob.org/article/3013.html[https://www.plob.org/article/3013.html]做基因組數(shù)據(jù)...
@haiyong6 謝謝
cpolar實(shí)現(xiàn)免費(fèi)的內(nèi)網(wǎng)穿透背景 雖然自己有一臺阿里云的服務(wù)器,但是限于云服務(wù)器的配置不高,存儲也不大,想著以后如若有擴(kuò)展存儲的需求與其購買加錢,不如自己在本地搭一個樹莓派跑一些自己需要的服務(wù)。但是絕大...
@haiyong6 這兩個哪個好用一些呢?
cpolar實(shí)現(xiàn)免費(fèi)的內(nèi)網(wǎng)穿透背景 雖然自己有一臺阿里云的服務(wù)器,但是限于云服務(wù)器的配置不高,存儲也不大,想著以后如若有擴(kuò)展存儲的需求與其購買加錢,不如自己在本地搭一個樹莓派跑一些自己需要的服務(wù)。但是絕大...
samtools fastq本身就能轉(zhuǎn)換成fastq文件,沒必要換一個軟件,samtools就是一個神器
從BAM文件提取unmapped reads并轉(zhuǎn)換成fastq格式用到的程序,samtools和bedtools,都用conda安裝。 目標(biāo)是將第一次比對的bam中unmapped reads提取出來,并轉(zhuǎn)換成fastq進(jìn)行下次比對。 第一...
@李昭_hzau 謝謝,這種拆分染色體跑出來的結(jié)果會不會影響整體的區(qū)間計算呢
DeepBSA的使用介紹簡介:混池測序分析(Bulked segregant analysis)是一種省時省力、廣泛應(yīng)用于挖掘性狀遺傳位點(diǎn)的方法,已有多種相應(yīng)算法被開發(fā)出來。包括基于高低池等位基因頻...
這個太耗資源了,一般電腦跑不動,載入VCF文件直接卡死重啟了,沒有Linux版本??
DeepBSA的使用介紹簡介:混池測序分析(Bulked segregant analysis)是一種省時省力、廣泛應(yīng)用于挖掘性狀遺傳位點(diǎn)的方法,已有多種相應(yīng)算法被開發(fā)出來。包括基于高低池等位基因頻...
1和2好像沒什么區(qū)別
anaconda3 | 使用中常見錯誤1. conda安裝環(huán)境報錯:Solving environment: failed with initial frozen solve. 方案1:首先,把你安裝的anaco...
總結(jié)的不錯,WGDI把共線性分析做到了極致,JCVI把可視化做到了極致,其實(shí)WGDI的結(jié)果文件可以調(diào)整一下,用JCVI可視化
分析 | 比較基因組 | 共線性分析網(wǎng)上已經(jīng)有很多教程,自己嘗試梳理。 共線性分析,你會想到什么?基于蛋白編碼基因1.1 MCScanX[https://github.com/wyp1125/MCScanX] ...
@賣萌哥 沒必要過濾吧? LACHESIS 不是有個設(shè)置參數(shù)嗎 CLUSTER_MAX_LINK_DENSITY
lachesis輔助組裝流程準(zhǔn)備工作: 準(zhǔn)備數(shù)據(jù)參考基因組:Ler-1.allpaths_lg.final.assembly.fastaHiC數(shù)據(jù):data_1.fastq.gz data_2.f...
我提的問題居然被采納了??
小工具 | 滑窗計算GCskew / GCratio / Nratio寫在前面 最近可以用來工作的時間少得可憐...但項(xiàng)目總歸是要一步一步推進(jìn)。每天都可能會懷疑人生,然后遺忘或者突破這個懷疑?;蛟S這就是人生無可奈何的一部分?;氐街黝}。前述,開設(shè)...
@vicLeo 最后我用conda安裝java11解決了,非常感謝作者的分享
snpEff注釋vcf前構(gòu)建庫的Error :CDS check file cds.fa' not found. Protein check file not found. Database c...conda activate java12 #進(jìn)入還有java高版本的conda所屬環(huán)境snpEff #啟動 snpEff 構(gòu)建小鼠的數(shù)據(jù)庫 先進(jìn)入 snpeff-5.1-1...
請問怎么在conda 環(huán)境里安裝java12呢?
snpEff注釋vcf前構(gòu)建庫的Error :CDS check file cds.fa' not found. Protein check file not found. Database c...conda activate java12 #進(jìn)入還有java高版本的conda所屬環(huán)境snpEff #啟動 snpEff 構(gòu)建小鼠的數(shù)據(jù)庫 先進(jìn)入 snpeff-5.1-1...
很棒的教程,請問蛋白對接好之后怎么得到精確的互作位點(diǎn)呢?
來一場蛋白與蛋白間的“風(fēng)花雪月”一、引子 ??2005年,Wigge等【1】在《Science》上報道了擬南芥“誘導(dǎo)開花”的信號調(diào)控通路,簡言之:在擬南芥體內(nèi),一個叫做FLOWERING LOCUS T (...
@bio_meow 我做了,那個scale只能做行或者列的標(biāo)準(zhǔn)化,做完圖就不是對稱的了
R相關(guān)性分析和相關(guān)性熱圖相關(guān)性分析 相關(guān)性分析是指對兩個或多個具備相關(guān)性的變量元素進(jìn)行分析,從而衡量兩個變量因素的相關(guān)密切程度。相關(guān)性分析旨在研究兩個或兩個以上隨機(jī)變量之間相互依存關(guān)系的方向和密切程...