IP屬地：河北
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我的aspera密碼，我怎么沒印象我有這個密碼呢？能給解釋一下嗎
2020-09-29 使用Aspera從EBI或NCBI下載基因組數(shù)據(jù)
來源：https://www.plob.org/article/3013.html[https://www.plob.org/article/3013.html]做基因組數(shù)據(jù)...
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什么時候可以畢業(yè)?_?
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@haiyong6 謝謝
cpolar實現(xiàn)免費的內(nèi)網(wǎng)穿透
背景 雖然自己有一臺阿里云的服務(wù)器，但是限于云服務(wù)器的配置不高，存儲也不大，想著以后如若有擴展存儲的需求與其購買加錢，不如自己在本地搭一個樹莓派跑一些自己需要的服務(wù)。但是絕大...
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@haiyong6 這兩個哪個好用一些呢？
cpolar實現(xiàn)免費的內(nèi)網(wǎng)穿透
背景 雖然自己有一臺阿里云的服務(wù)器，但是限于云服務(wù)器的配置不高，存儲也不大，想著以后如若有擴展存儲的需求與其購買加錢，不如自己在本地搭一個樹莓派跑一些自己需要的服務(wù)。但是絕大...
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samtools fastq本身就能轉(zhuǎn)換成fastq文件，沒必要換一個軟件，samtools就是一個神器
從BAM文件提取unmapped reads并轉(zhuǎn)換成fastq格式
用到的程序，samtools和bedtools，都用conda安裝。 目標(biāo)是將第一次比對的bam中unmapped reads提取出來，并轉(zhuǎn)換成fastq進(jìn)行下次比對。 第一...
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@李昭_hzau 謝謝，這種拆分染色體跑出來的結(jié)果會不會影響整體的區(qū)間計算呢
DeepBSA的使用介紹
簡介：混池測序分析（Bulked segregant analysis）是一種省時省力、廣泛應(yīng)用于挖掘性狀遺傳位點的方法，已有多種相應(yīng)算法被開發(fā)出來。包括基于高低池等位基因頻...
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這個太耗資源了，一般電腦跑不動，載入VCF文件直接卡死重啟了，沒有Linux版本??
DeepBSA的使用介紹
簡介：混池測序分析（Bulked segregant analysis）是一種省時省力、廣泛應(yīng)用于挖掘性狀遺傳位點的方法，已有多種相應(yīng)算法被開發(fā)出來。包括基于高低池等位基因頻...
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1和2好像沒什么區(qū)別
anaconda3 | 使用中常見錯誤
1. conda安裝環(huán)境報錯：Solving environment: failed with initial frozen solve. 方案1：首先，把你安裝的anaco...
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總結(jié)的不錯，WGDI把共線性分析做到了極致，JCVI把可視化做到了極致，其實WGDI的結(jié)果文件可以調(diào)整一下，用JCVI可視化
分析 | 比較基因組 | 共線性分析
網(wǎng)上已經(jīng)有很多教程，自己嘗試梳理。 共線性分析，你會想到什么？基于蛋白編碼基因1.1 MCScanX[https://github.com/wyp1125/MCScanX] ...
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@賣萌哥 沒必要過濾吧？ LACHESIS 不是有個設(shè)置參數(shù)嗎 CLUSTER_MAX_LINK_DENSITY
lachesis輔助組裝流程
準(zhǔn)備工作： 準(zhǔn)備數(shù)據(jù)參考基因組：Ler-1.allpaths_lg.final.assembly.fastaHiC數(shù)據(jù)：data_1.fastq.gz data_2.f...
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我提的問題居然被采納了??
小工具 | 滑窗計算GCskew / GCratio / Nratio
寫在前面 最近可以用來工作的時間少得可憐...但項目總歸是要一步一步推進(jìn)。每天都可能會懷疑人生，然后遺忘或者突破這個懷疑。或許這就是人生無可奈何的一部分?；氐街黝}。前述，開設(shè)...
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@vicLeo 最后我用conda安裝java11解決了，非常感謝作者的分享
snpEff注釋vcf前構(gòu)建庫的Error ：CDS check file cds.fa' not found. Protein check file not found. Database c...
conda activate java12 #進(jìn)入還有java高版本的conda所屬環(huán)境snpEff #啟動 snpEff 構(gòu)建小鼠的數(shù)據(jù)庫 先進(jìn)入 snpeff-5.1-1...
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請問怎么在conda 環(huán)境里安裝java12呢？
snpEff注釋vcf前構(gòu)建庫的Error ：CDS check file cds.fa' not found. Protein check file not found. Database c...
conda activate java12 #進(jìn)入還有java高版本的conda所屬環(huán)境snpEff #啟動 snpEff 構(gòu)建小鼠的數(shù)據(jù)庫 先進(jìn)入 snpeff-5.1-1...
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很棒的教程，請問蛋白對接好之后怎么得到精確的互作位點呢？
來一場蛋白與蛋白間的“風(fēng)花雪月”
一、引子 ??2005年，Wigge等【1】在《Science》上報道了擬南芥“誘導(dǎo)開花”的信號調(diào)控通路，簡言之：在擬南芥體內(nèi)，一個叫做FLOWERING LOCUS T (...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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@bio_meow 我做了，那個scale只能做行或者列的標(biāo)準(zhǔn)化，做完圖就不是對稱的了
R相關(guān)性分析和相關(guān)性熱圖
相關(guān)性分析 相關(guān)性分析是指對兩個或多個具備相關(guān)性的變量元素進(jìn)行分析，從而衡量兩個變量因素的相關(guān)密切程度。相關(guān)性分析旨在研究兩個或兩個以上隨機變量之間相互依存關(guān)系的方向和密切程...
