前述,我們提起,王驍老鐵開發(fā)了一個(gè) TBtools-Rplugin。這個(gè) Plugin 事實(shí)上是一個(gè) R ShinyApp。使用這個(gè)插件,幾乎所有人可以在自己的電腦上輕松完成...
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前面的文章中完成了數(shù)據(jù)導(dǎo)入和網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,下面是將基因模塊與性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián),從而識別與表型相關(guān)的重要基因。WGCNA(1):R包安裝及數(shù)據(jù)導(dǎo)入清洗 - 簡書 (jianshu.co...
簡介 這是一款2017年發(fā)表在NAR上的注釋LncRNA的工具,F(xiàn)EELnc: a tool for long non-coding RNA annotation and i...
首先我是這是我日常逛 twitter 看到的,然后我又是一個(gè)搬運(yùn)工( emmm,這個(gè)系列都沒有詢問作者意見,后面如果有意外就刪了。 ) 書籍在線版:R for Data Sc...
ggh4x是ggplot2的擴(kuò)展包,其火星文發(fā)音為G-G-hacks。主要功能包括調(diào)整分面大小(adjusting the sizes of facets),mapping ...
重演一篇傻瓜式GWAS分析|培養(yǎng)興趣專用[https://zhuanlan.zhihu.com/p/139428767] 發(fā)布于 2020-05-10 18:58 全基因組關(guān)...
哈嘍,我想問一下,不同物種(遠(yuǎn)緣)的重測序數(shù)據(jù)為什么可以比對到不同物種上,并且還具備較高的覆蓋深度。
測序數(shù)據(jù)的深度、覆蓋度等計(jì)算Coverage Depth 覆蓋深度 mapping depth 基因組被測序片段(短讀 short reads)“覆蓋”的強(qiáng)度有多大? 每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測序...
文末可下載示例數(shù)據(jù)和代碼。 前幾天,老師讓我畫一個(gè)這樣的圖。 粗略一看,似乎沒有什么特別困難的地方,好像之前也看到過類似的圖,但是看到老師發(fā)來的鏈接才發(fā)現(xiàn)這居然是Nature...
寫本篇文章,主要目的是從tmp文件和軟件運(yùn)行信息解讀亞基因組分型分析。 進(jìn)入tmp文件夾之后,其實(shí)就可以看到對應(yīng)的文件: 如何查看什么步驟產(chǎn)生了怎么樣的結(jié)果文件? 上述在進(jìn)行...