前述，我們提起，王驍老鐵開發(fā)了一個(gè) TBtools-Rplugin。這個(gè) Plugin 事實(shí)上是一個(gè) R ShinyApp。使用這個(gè)插件，幾乎所有人可以在自己的電腦上輕松完成...
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超高速 WGCNA-基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 ~ -
WGCNA（3）：基因模塊與性狀關(guān)聯(lián)識(shí)別重要基因前面的文章中完成了數(shù)據(jù)導(dǎo)入和網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建，下面是將基因模塊與性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)，從而識(shí)別與表型相關(guān)的重要基因。WGCNA（1）：R包安裝及數(shù)據(jù)導(dǎo)入清洗 - 簡(jiǎn)書 (jianshu.co...
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2022年，魚躍龍門！積極主動(dòng)，逆天改命！
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平生無用是逍遙，<br>應(yīng)悔曾效楚歌狂。<br>提筆可堪猶風(fēng)骨，<br>彈劍何處躍飛骦。<br>耒陽推酒鳳凰落，<br>白帝叮嚀臥龍殤。<br>人間有恨傳千古，<br>不負(fù)蒼生不負(fù)王。
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FEELnc: LncRNA注釋工具簡(jiǎn)介 這是一款2017年發(fā)表在NAR上的注釋LncRNA的工具，F(xiàn)EELnc: a tool for long non-coding RNA annotation and i...
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TidyTuesday 可視化學(xué)習(xí)之 網(wǎng)絡(luò)圖（ igraph 和 ggraph） 繪制首先我是這是我日常逛 twitter 看到的，然后我又是一個(gè)搬運(yùn)工（ emmm，這個(gè)系列都沒有詢問作者意見，后面如果有意外就刪了。 ） 書籍在線版：R for Data Sc...
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公眾號(hào) R語言數(shù)據(jù)分析指南，歡迎大家關(guān)注
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【R>>ggh4x】ggplot2分面hacksggh4x是ggplot2的擴(kuò)展包，其火星文發(fā)音為G-G-hacks。主要功能包括調(diào)整分面大小(adjusting the sizes of facets)，mapping ...
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好記性不如爛筆頭，溫故而知新。踏實(shí)一些，不要著急，你想要的歲月都會(huì)給你！
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重演一篇傻瓜式GWAS分析|培養(yǎng)興趣專用重演一篇傻瓜式GWAS分析|培養(yǎng)興趣專用[https://zhuanlan.zhihu.com/p/139428767] 發(fā)布于 2020-05-10 18:58 全基因組關(guān)...
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命運(yùn)把你帶到那里，那你就大大方方的去
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不愿閉門造車<br>歡迎批評(píng)指正
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哈嘍，我想問一下，不同物種（遠(yuǎn)緣）的重測(cè)序數(shù)據(jù)為什么可以比對(duì)到不同物種上，并且還具備較高的覆蓋深度。
測(cè)序數(shù)據(jù)的深度、覆蓋度等計(jì)算
Coverage Depth 覆蓋深度 mapping depth 基因組被測(cè)序片段（短讀 short reads）“覆蓋”的強(qiáng)度有多大？ 每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測(cè)序...
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R繪圖|染色體SNP指數(shù)圖繪制文末可下載示例數(shù)據(jù)和代碼。 前幾天，老師讓我畫一個(gè)這樣的圖。 粗略一看，似乎沒有什么特別困難的地方，好像之前也看到過類似的圖，但是看到老師發(fā)來的鏈接才發(fā)現(xiàn)這居然是Nature...
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主要分享一些自己的學(xué)習(xí)過程，以菜鳥干貨為主，大家有問題可以在我的博客交流(打賞也是)<br><br>
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【SubPhaser-多倍體亞基因組分型流程解讀】寫本篇文章，主要目的是從tmp文件和軟件運(yùn)行信息解讀亞基因組分型分析。 進(jìn)入tmp文件夾之后，其實(shí)就可以看到對(duì)應(yīng)的文件： 如何查看什么步驟產(chǎn)生了怎么樣的結(jié)果文件？ 上述在進(jìn)行...
