前言 只有光頭才能變強(qiáng) 這個(gè)學(xué)期開(kāi)了Linux的課程了，授課的老師也是比較負(fù)責(zé)任的一位?？偟膩?lái)說(shuō)也算是比較系統(tǒng)地學(xué)習(xí)了一下Linux了~~~ 本文章主要是總結(jié)Linux的基礎(chǔ)...
IP屬地：吉林
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看完這篇Linux基本的操作就會(huì)了
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ggplot2添加p值和顯著性數(shù)據(jù)可視化分析中我們經(jīng)常需要進(jìn)行數(shù)據(jù)間的統(tǒng)計(jì)分析，并進(jìn)行顯著性標(biāo)記，雖然ggpur包被大佬吐槽制造混亂，但在進(jìn)行顯著性標(biāo)記標(biāo)記方面也是有其可取之處。 下面主要展示ggpubr...
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根據(jù)基因間相關(guān)性系數(shù)R進(jìn)行GSEA富集分析
根據(jù)rawdata算出來(lái)FPKM，然后進(jìn)行單個(gè)基因與其他基因之間相關(guān)性的計(jì)算 轉(zhuǎn)置后文件內(nèi)容為：縱坐標(biāo)是樣本名稱，橫坐標(biāo)是不同基因的Ensembl 這樣就算好了基因間的相關(guān)性...
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WGCNA（5）：模塊導(dǎo)出至其他可視化軟件
這篇文章是WGCNA系列的最后一篇，其余見(jiàn)鏈接：WGCNA（1）：R包安裝及數(shù)據(jù)導(dǎo)入清洗 - 簡(jiǎn)書(shū) (jianshu.com)[http://www.itdecent.cn...
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WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因
WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因 原創(chuàng) 生信技能樹(shù) 我在生信技能樹(shù)多次寫(xiě)教程分享WGCNA的實(shí)戰(zhàn)細(xì)節(jié)，見(jiàn)： 一文看懂WGCNA 分析(2019更新版)[ht...
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小鬼的WGCNA圖文詳解(一)--軟閾值最近有很多人在給他們做完了WGCNA分析之后，跑過(guò)來(lái)問(wèn)結(jié)果中各種圖片的意思。我就整理一下WGCNA分析結(jié)果中常見(jiàn)圖片的含義吧，如有理解錯(cuò)誤，還請(qǐng)各位大神批評(píng)指正！ 首先，當(dāng)然...
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如何查找“鐵代謝”相關(guān)的基因？
鐵（iron）是人體必需的微量元素，存在于所有細(xì)胞中。除紅細(xì)胞生成外，鐵還參與各種生理和病理過(guò)程，例如氧氣運(yùn)輸和儲(chǔ)存、線粒體功能和免疫系統(tǒng)（Crielaard等，2017）。...
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12.4?使用dplyr管道操作處理數(shù)據(jù)框關(guān)于數(shù)據(jù)操作的另一個(gè)流行的包是dplyr，它發(fā)明了一種數(shù)據(jù)操作語(yǔ)法。dplyr擴(kuò)展包并沒(méi)有使用構(gòu)建子集函數(shù)（[ ]），而是定義了一系列基礎(chǔ)的變形函數(shù)作為數(shù)據(jù)操作模塊，并且引入...
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鐵死亡相關(guān)基因集鐵死亡（Ferroptosis）最早由哥倫比亞大學(xué)Dr. Brent R.Stockwell在2012年提出，是一種鐵依賴性的，區(qū)別于細(xì)胞凋亡、細(xì)胞壞死、細(xì)胞自噬的新型的細(xì)胞...
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“GSEA簡(jiǎn)易分析工具”和” GSEA結(jié)果可視化工具”為了解決四個(gè)難題我們?cè)O(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)了“GSEA簡(jiǎn)易分析工具”和” GSEA結(jié)果可視化工具” 01—研究背景 Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分...
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生信練習(xí)生
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生物信息學(xué)
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生信數(shù)據(jù)庫(kù)1: cBioportal數(shù)據(jù)庫(kù)(突變分析與可視化)cBioPortal數(shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)包含TCGA和ICGC等大型的腫瘤研究項(xiàng)目，并整合癌癥基因數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)的國(guó)際公共數(shù)據(jù)庫(kù)，其整合的基因組數(shù)據(jù)類型包括體細(xì)胞突變、DNA 拷貝數(shù)...
