怎么網(wǎng)上都是這一個(gè)帖子
基于orthofinder 結(jié)果構(gòu)建物種樹串聯(lián)法 orthofinder 已經(jīng)生成好單拷貝基因串聯(lián)的序列，可以直接使用。找到orthofinder 已經(jīng)生成好單拷貝基因串聯(lián)的序列，SpeciesTreeAlignme...
發(fā)簡信
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分享生信知識。全網(wǎng)同名，有問題搜索工種昊留言??
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為什么我的沒有continue mapping
用cytoscape畫網(wǎng)絡(luò)圖
經(jīng)常看到文章中有那種好漂亮的網(wǎng)絡(luò)圖，偶也想自己畫一個(gè)呢，但是不會(huì)咋整呢？ 別急，今天本椒就分享一下用cytoscape畫互作網(wǎng)絡(luò)圖！ 看一遍就會(huì)啦。。。還不會(huì)！那就多看幾遍哈...
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正負(fù)相關(guān)怎么用線條顏色設(shè)置
用cytoscape畫網(wǎng)絡(luò)圖
經(jīng)?？吹轿恼轮杏心欠N好漂亮的網(wǎng)絡(luò)圖，偶也想自己畫一個(gè)呢，但是不會(huì)咋整呢？ 別急，今天本椒就分享一下用cytoscape畫互作網(wǎng)絡(luò)圖！ 看一遍就會(huì)啦。。。還不會(huì)！那就多看幾遍哈...
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非常詳細(xì)的一篇教程了
用cytoscape畫網(wǎng)絡(luò)圖
經(jīng)?？吹轿恼轮杏心欠N好漂亮的網(wǎng)絡(luò)圖，偶也想自己畫一個(gè)呢，但是不會(huì)咋整呢？ 別急，今天本椒就分享一下用cytoscape畫互作網(wǎng)絡(luò)圖！ 看一遍就會(huì)啦。。。還不會(huì)！那就多看幾遍哈...
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@GPZ_Lab 我也想知道怎么導(dǎo)出結(jié)果
R使用筆記：相關(guān)系數(shù):cor.test();corr.test();rcorr()
本次筆記內(nèi)容：cor.test()和cor()rcorr() {Hmisc}corr.test() {psych}spearmanCI() {spearmanCI} spea...
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@小潤澤 啊…不是。我從數(shù)據(jù)庫下載數(shù)據(jù)，它有contig scaffold complete水平。
為什么contig不組裝到complete水平。
是組裝不到，還是人沒有組裝基因組組裝和注釋理論
基因組組裝 1.k-mer 那么我們首先要看一下k-mer是什么。它的定義是：是指將一條序列分成包含k個(gè)堿基的子字符串，如果reads長度為L，k-mer長度設(shè)為k，則產(chǎn)生的...
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@小潤澤 為什么會(huì)有coting scaffold complete組裝水平，為什么不都組裝到complete.是人為沒有組裝到complete水平，還是它序列本身組裝到complete水平
基因組組裝和注釋理論
基因組組裝 1.k-mer 那么我們首先要看一下k-mer是什么。它的定義是：是指將一條序列分成包含k個(gè)堿基的子字符串，如果reads長度為L，k-mer長度設(shè)為k，則產(chǎn)生的...
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科服：生信、AI、育種。全網(wǎng)同號
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序列組裝水平，會(huì)影響注釋結(jié)果嗎？
宏基因組分箱（六）Prokka基因預(yù)測，注釋COG、EC、RNA
導(dǎo)讀 prokka注釋細(xì)菌基因組，獲得該基因組的CDS、Gene、RNA、EC、COG等注釋信息。 一、基本信息 文章：Prokka: rapid prokaryotic g...
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基因組裝水平會(huì)影響注釋結(jié)果嗎
「生信軟件」好用的細(xì)菌基因組組裝與注釋軟件
1. Spades[https://github.com/ablab/spades] 細(xì)菌基因組組裝最佳軟件(主觀感受)，可進(jìn)行二代組裝，三代組裝以及二代三代混合組裝。 2...
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想問組裝水平會(huì)影響KEGG注釋結(jié)果呢
基因組組裝和注釋理論
基因組組裝 1.k-mer 那么我們首先要看一下k-mer是什么。它的定義是：是指將一條序列分成包含k個(gè)堿基的子字符串，如果reads長度為L，k-mer長度設(shè)為k，則產(chǎn)生的...
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救命??！為什么輸出了四個(gè)空文檔
零基礎(chǔ)快速完成基因功能注釋 / GO / KEGG / PFAM...
寫在前面 早前已經(jīng)推過《新手eggNOG-Mapper詳細(xì)教程》，但仍然有很多人遇到使用問題。換句話，可能那個(gè)教程不能徹底解決大伙遇到的問題。于是我決定寫一個(gè)完美的教程，徹底...
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致力于成為生信全棧工程師
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如果是要.faa格式的 是不是 -faa
autoprokka:使用prokka批量注釋
autoprokka.py這個(gè)Python腳本可以方便地批量地使用prokka去進(jìn)行注釋，自動(dòng)按照輸入文件名去命名輸出文件，并且每個(gè)樣本單獨(dú)一個(gè)文件夾存放注釋后結(jié)果，.gff...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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