我不是老師，也不是大神，更不是前輩。我只是個普通的科研工作者，一個只想努力變得更好的人。 來到簡書快3年了，期間寫了不少的筆記。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時wfh的時候?qū)懙摹Ｖ两?..
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WGCNA學(xué)習(xí)筆記本篇代碼參考文章:1.生信菜鳥團(tuán)：一文學(xué)會WGCNA分析2.WGCNA（加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析）3.WGCNA分析，簡單全面的最新教程4.WGCNA實戰(zhàn)練習(xí)5.STEP6:W...
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全基因組選擇的模型匯總（轉(zhuǎn)載）本文轉(zhuǎn)載自：Bionifarmer[https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/14375487.html]。個人感覺非常好。如有侵權(quán)，請聯(lián)系我。...
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Cell-單細(xì)胞ATAC-seq繪制哺乳動物單細(xì)胞染色質(zhì)調(diào)控圖譜??DNA就像纏繞在一起的繩索，包裝好的DNA被稱為染色質(zhì)，其內(nèi)部組織影響基因在每個細(xì)胞中如何發(fā)揮作用。核小體是由DNA與組蛋白形成的染色質(zhì)基本結(jié)構(gòu)單位，實際上通過移動開啟或...
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ChIP-seq詳細(xì)分析流程參考生信技能樹1以及生信技能樹2只記錄從數(shù)據(jù)下載，到最終結(jié)果展示，具體生物學(xué)知識請自行查閱稍后關(guān)于ChIP-seq的背景知識我會再發(fā)布一篇文章。數(shù)據(jù)下載：數(shù)據(jù)存放地址關(guān)于環(huán)境...
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MACS2學(xué)習(xí)筆記
安裝默認(rèn)使用Conda macs2的基本命令 輸出文件包括 為了方便在IGV上查看ChIP-seq的結(jié)果和后期的可視化展示，所以我們需要把macs2的結(jié)果轉(zhuǎn)化為bw提供給IG...
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MACS2 進(jìn)行peak calling整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析時用到的工具。本文只對使用的工具用法進(jìn)行簡單介紹。 MACS2 是一款常用的peak calling軟件，可以鑒定ChIP-...
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表觀組學(xué)：call peak概念和MACS2算法原理，最簡明清晰的call peak一文通在諸如：ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq(m6A)、Cut&Tag中我們常常聽到一個詞Call Peak。Call Peak究竟是什么東西，得到的結(jié)果又...
