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TBtools | 基因家族分析 (進化樹、Motifs、結(jié)構(gòu)域)再次體驗一下TBtools的強大。使用TBtools對基因家族進行分析，進化樹、Motifs 、結(jié)構(gòu)域和基因結(jié)構(gòu)多圖合一。 一、數(shù)據(jù)準備 1.基因組組裝結(jié)果fasta格式 2...
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引物設(shè)計原則 及 Primer Premier 6 批量引物設(shè)計本文來源：互聯(lián)網(wǎng)，侵權(quán)刪 篇一：引物設(shè)計原則 剛做實驗的同學，很多時候希望別人幫自己設(shè)計好引物，其實這種方式是不可取的，首先是高估了引物設(shè)計 的難度，其次也自己的實驗別人了解...
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基因結(jié)構(gòu)基因結(jié)構(gòu)包括編碼區(qū)（CDS）和非編碼區(qū) 編碼區(qū)：不連續(xù)的基因結(jié)構(gòu)，包含外顯子和內(nèi)含子，它們交替出現(xiàn)。CDS序列以ATG開始，起始密碼子只有這一個，并且在外顯子中。 （1）外顯...
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比較基因組學之-同源基因概念
最近看文獻，有兩個詞Homologs、 Orthologs的含義總是分不清，查了一下，結(jié)果需要學習的東西越查越多。 直系同源基因 - Orthologous genes (o...
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我很懶，但是我很可愛~~
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核酸和蛋白質(zhì)序列比對與序列特征分析
寫在前面，其中的一些具體原理包括算法以后或許會詳細添加。主要參考主源自李霞老師主編《生物信息學理論與醫(yī)學實踐》，陳銘《生物信息學》，馮世鵬《實用生物信息學》，冉隆科《生物信息...
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如何獲得一個基因的結(jié)構(gòu)域呢？CDD數(shù)據(jù)庫的使用導師交給我一個基因，該怎么去查詢這個基因的保守結(jié)構(gòu)域，以便我后續(xù)對這個基因的進一步研究呢？話不多說直接上圖： 1. NCBI中CDD數(shù)據(jù)庫的查詢和使用 打開NCBI首頁，...
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如何利用NCBI預測基因的結(jié)構(gòu)域和保守位點1. 使用CD-Search工具來可以鑒定蛋白質(zhì)或者核酸序列內(nèi)的保守結(jié)構(gòu)域或功能單位。該工具位于NCBI中。具體我們可以進入NCBI后選擇Conserved Domain然后...
