再次體驗一下TBtools的強大。使用TBtools對基因家族進行分析,進化樹、Motifs 、結(jié)構(gòu)域和基因結(jié)構(gòu)多圖合一。 一、數(shù)據(jù)準備 1.基因組組裝結(jié)果fasta格式 2...
本文來源:互聯(lián)網(wǎng),侵權(quán)刪 篇一:引物設(shè)計原則 剛做實驗的同學,很多時候希望別人幫自己設(shè)計好引物,其實這種方式是不可取的,首先是高估了引物設(shè)計 的難度,其次也自己的實驗別人了解...
基因結(jié)構(gòu)包括編碼區(qū)(CDS)和非編碼區(qū) 編碼區(qū):不連續(xù)的基因結(jié)構(gòu),包含外顯子和內(nèi)含子,它們交替出現(xiàn)。CDS序列以ATG開始,起始密碼子只有這一個,并且在外顯子中。 (1)外顯...
最近看文獻,有兩個詞Homologs、 Orthologs的含義總是分不清,查了一下,結(jié)果需要學習的東西越查越多。 直系同源基因 - Orthologous genes (o...
寫在前面,其中的一些具體原理包括算法以后或許會詳細添加。主要參考主源自李霞老師主編《生物信息學理論與醫(yī)學實踐》,陳銘《生物信息學》,馮世鵬《實用生物信息學》,冉隆科《生物信息...
導師交給我一個基因,該怎么去查詢這個基因的保守結(jié)構(gòu)域,以便我后續(xù)對這個基因的進一步研究呢?話不多說直接上圖: 1. NCBI中CDD數(shù)據(jù)庫的查詢和使用 打開NCBI首頁,...
1. 使用CD-Search工具來可以鑒定蛋白質(zhì)或者核酸序列內(nèi)的保守結(jié)構(gòu)域或功能單位。該工具位于NCBI中。具體我們可以進入NCBI后選擇Conserved Domain然后...