IP屬地：北京
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TCGA數據整合后進行DESeq2差異表達分析和基于R的多種可視化測序上游分析系列： mRNA-seq轉錄組二代測序從raw reads到表達矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
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最近不常登陸簡書，若評論問題沒有及時回復，可以發(fā)郵件交流 bioinfortime@163.com
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你是如何查看電腦里有幾個版本的R
Rstudio一片空白怎么辦？
R軟件差不多半年就能出款新的，有的包只能在更新的版本上使用，所以嘗試了一下更新R。R不同版本相當于獨立的軟件，電腦上允許同時有多個版本的R。下載只要在默認路徑下安裝，Rstu...
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北京中醫(yī)藥大學博士，一個會科研的中醫(yī)大夫
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Rstudio一片空白怎么辦？R軟件差不多半年就能出款新的，有的包只能在更新的版本上使用，所以嘗試了一下更新R。R不同版本相當于獨立的軟件，電腦上允許同時有多個版本的R。下載只要在默認路徑下安裝，Rstu...
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生信技能樹，生信菜鳥團，jimmy
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單細胞技術，分析方法
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質控，組裝，預測，注釋，比較，進化一條龍
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一些生物信息學用到的軟件，工具，介紹用法安裝以及以及應用的文章 ?? 測序組裝使用的Spades、canu等等 ?? 序列比對比如blast、bowtie、diamond等 ?? 多序列比對比如mega、clustalW、matff等 ?? 序列格式轉化的samtools、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進化樹構建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 ?? 尋找測序中的結構變異或者SNP序列GATK、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o、QIMME ?? 測序質量評估的FastQC、BUSCO、QUAST ?? 可視化工具比如IGV、3D Genome ?? 測序數據下載工具SRA Toolkit、ascp等 ?? 數據可視化的工具circos 等等
