起因：最近有個問題樣本，跑完cellranger，樣本的cellranger結(jié)果如下，細胞數(shù)目極高(3W+)。在后續(xù)數(shù)據(jù)質(zhì)控分析中，線粒體基因占比和雙細胞率均很高，用scDb...
IP屬地：山東
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單細胞轉(zhuǎn)錄組雙細胞判別軟件scDblFinder -
scDblFinder: detect doublet
https://github.com/plger/scDblFinder[https://github.com/plger/scDblFinder] require(zell...
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scdbfinder 支持seurat V5嗎。v5新增加了格式變化
單細胞數(shù)據(jù)分析筆記3: 雙細胞去除（DoubletFinder, scDblFinder)
雙細胞是指由于實驗原因，在單細胞微流控等流程中某個液滴中含有2個及以上的細胞，而在同一個液滴中的細胞在后續(xù)分析中帶有相同的Cell Barcode，從而會被認為是一個細胞的偽...
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scRNAseq雙細胞去除-1: DoubletFinder10x平臺的雙細胞率（符合泊松分布1）： 根據(jù)Poisson分布，單個液滴包含超過一個細胞（doublets或multiplets）的頻率隨著上機細胞的濃度而改變。通常如果上...
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單細胞數(shù)據(jù)分析筆記3: 雙細胞去除（DoubletFinder, scDblFinder)雙細胞是指由于實驗原因，在單細胞微流控等流程中某個液滴中含有2個及以上的細胞，而在同一個液滴中的細胞在后續(xù)分析中帶有相同的Cell Barcode，從而會被認為是一個細胞的偽...
