一條小咸魚
IP屬地：湖南
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Windows操作系統(tǒng)下Haploview軟件的安裝學(xué)習(xí)筆記一、Haploview軟件的安裝依賴于java環(huán)境，因此在進(jìn)行安裝前要先安裝java。 1.官網(wǎng)下載 https://www.oracle.com/java/technolo...
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生物信息學(xué)軟件，perl、python、R、shell腳本交流分享
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https://www.yuque.com/docs/share/bc6f89aa-9de3-4482-ba9f-cd2826b706c7?# 《如何加入單細(xì)胞 腫瘤生信群》 腫瘤前沿資訊分享 腫瘤學(xué) 生物信息學(xué) 蛋白組 代謝組 多組學(xué) 病理學(xué) 會(huì)議 臨檢 精準(zhǔn)醫(yī)療與早篩 制藥 免疫 腸道微生物 統(tǒng)計(jì) 算法 AI 機(jī)器學(xué)習(xí) 分子生物學(xué) 基因編輯 腫瘤科普 開源分析、繪圖代碼 科研思路 科研軟件 干細(xì)胞 組織學(xué)與胚胎學(xué) 發(fā)育
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收集收集三代測(cè)序相關(guān)資料
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章。感謝這些簡(jiǎn)友整理的生信分析流程！ 如果簡(jiǎn)友投稿沒(méi)有被我收入專題，可能是我沒(méi)看到或者收入到其他針對(duì)性更強(qiáng)的專題中了。望見(jiàn)諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時(shí)候請(qǐng)點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看。 ?? 全基因組測(cè)序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測(cè)序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過(guò)程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過(guò)程 ?? 數(shù)據(jù)庫(kù)的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來(lái)的流程 ?? ?? ??
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矯正基因結(jié)構(gòu)注釋 - 做有良心的基因家族分析寫在前面 半個(gè)月前，我推了一個(gè)《任何人都能掌握-基因家族分析》的騰訊課程（原本事實(shí)是開給課題組）。在熱身課程（完全免費(fèi)）中，將我個(gè)人對(duì)基因家族分析的認(rèn)知和其意義均做了說(shuō)明，感...
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進(jìn)化樹構(gòu)建方法的選取
比較幾種主要的構(gòu)樹方法，一般情況下，若有合適的分子進(jìn)化模型可供選擇，用最大似然法（ML）構(gòu)樹獲得的結(jié)果較好；對(duì)于近緣物種序列，通常情況下使用最大簡(jiǎn)約法(MP)；而對(duì)于遠(yuǎn)緣物種...
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TBtools - 已有插件列表
寫在前面 最近我主要在忙兩個(gè)事情： 了結(jié)學(xué)校里相關(guān)的一些事情，也整理下手上的資料和文件 看看是否有合適的工作 寫了一段關(guān)于找工作的感悟，不過(guò)還是刪了，哈哈。多數(shù)無(wú)益，回到主題...
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使用TBtools繪制進(jìn)化樹+motif分析+基因結(jié)構(gòu)~三圖合一今天推文的內(nèi)容重點(diǎn)是畫圖用到的輸入文件的準(zhǔn)備image.png 圖一 基因家族分析的論文中通常會(huì)把基因家族成員的進(jìn)化樹、基因結(jié)構(gòu)、motif分析放在一張圖里。效果如圖一。準(zhǔn)備...
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蛋白序列亞細(xì)胞定位工具評(píng)測(cè)
CELLO v.2.5: subCELlular LOcalization predictor 蛋白亞細(xì)胞定位訪問(wèn)網(wǎng)址：http://cello.life.nctu.edu....
