SLC26A1 is a major determinant of sulfate homeostasis in humans-19分 前言 磷酸鹽穩(wěn)態(tài)障礙與骨關(guān)節(jié)炎和軟骨疾...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：內(nèi)蒙古
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文獻(xiàn)閱讀：SLC26A1和磷酸鹽穩(wěn)態(tài)-J Clin Invest -
文獻(xiàn)閱讀：卵巢早衰nature medicine引言 卵巢功能不全的臨床有害性和發(fā)病率；其發(fā)病原因多，異質(zhì)性強(qiáng)；遺傳因素在疾病發(fā)病中發(fā)揮了作用，確定其分子遺傳基礎(chǔ)，為遺傳咨詢和優(yōu)生優(yōu)育有幫助（揭示研究意義）目前研究不足：1...
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基于基因的關(guān)聯(lián)分析的簡(jiǎn)單背景說(shuō)明
Burden 分析，是基于基因的關(guān)聯(lián)分析方法中的一種，應(yīng)該與基于位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)分析（GWAS），起到相輔相成，互相補(bǔ)充的作用。 傳統(tǒng)GWAS分析，主要是利用大樣本量，尋找病例對(duì)照...
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文章寫(xiě)的太好了，學(xué)習(xí)了很多！
基于基因的關(guān)聯(lián)分析的簡(jiǎn)單背景說(shuō)明
Burden 分析，是基于基因的關(guān)聯(lián)分析方法中的一種，應(yīng)該與基于位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)分析（GWAS），起到相輔相成，互相補(bǔ)充的作用。 傳統(tǒng)GWAS分析，主要是利用大樣本量，尋找病例對(duì)照...
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基因相關(guān)性的計(jì)算在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組解析肥厚性心肌病發(fā)病機(jī)制[http://www.itdecent.cn/p/f270b9431427]里面看到計(jì)算某基因與其它基因的相關(guān)性 方法里寫(xiě)的是這樣做...
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單細(xì)胞之富集分析-5：一張圖展示多組富集分析結(jié)果單細(xì)胞富集分析系列： 單細(xì)胞之富集分析-1：?jiǎn)渭?xì)胞GSEA分析流程[http://www.itdecent.cn/p/00f069cb239c] 單細(xì)胞之富集分析-2：批量...
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MAGMA軟件實(shí)現(xiàn)gene-based & gene-set-based關(guān)聯(lián)分析
作者：Bio_gevin審稿：童蒙編輯：amethyst 隨著全基因組關(guān)聯(lián)分析使用樣本數(shù)量的增加，人們也逐漸認(rèn)識(shí)到很多感興趣的性狀在本質(zhì)上是由微效多基因控制。單個(gè)SNP的關(guān)聯(lián)...
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蛋白三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法一 打開(kāi)Swiss model，輸入氨基酸序列，開(kāi)始預(yù)測(cè)，準(zhǔn)備下載PDB文件 GMQE分?jǐn)?shù)（0-1）越高越好，GMQE大于0.7則認(rèn)為準(zhǔn)確 這個(gè)方法得出的GMQE數(shù)值太低...
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突變基因多序列比對(duì)1.查找目標(biāo)基因的核酸序列 進(jìn)入NCBI，選擇這個(gè) 搜索目標(biāo)基因，選擇物種為人，找mRNA序列 可以直接看CDS 根據(jù)突變的CDS改變情況可以定位到這個(gè)序列的突變位點(diǎn) 找到這...
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
具體參考文章：1.https://blog.csdn.net/genetics/article/details/109153909?utm_medium=distribute...
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GEO單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)樣本拆分
這個(gè)數(shù)據(jù)包括了10個(gè)單細(xì)胞樣本，但是他們事先將數(shù)據(jù)合并了，其實(shí)我只需要其中的3個(gè)樣本，所以我需要拆分一下1.加載數(shù)據(jù) 2.正式拆分，使用tidyverse函數(shù) 3.按照樣本將...
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GO/KEGG富集分析及R包繪圖（氣泡圖/條形圖）導(dǎo)讀 利用富集分析，我們可以把很多看著雜亂的差異基因總結(jié)出一個(gè)比較整體反應(yīng)事件發(fā)生的概述性的句子。 例如：TP53信號(hào)通路和胃癌的發(fā)生有關(guān)。而不是說(shuō)BAX、BID、ABL1、...
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都能申請(qǐng)頻率數(shù)據(jù)嗎？
中國(guó)人的GWAS填充參考之南醫(yī)大和女?huà)z參考
南醫(yī)大參考 2022年9月15日，南京醫(yī)科大學(xué)沈洪兵、胡志斌團(tuán)隊(duì)在Cancer Cell上發(fā)表了題為 “Analyses of rare predisposing varia...
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為什么不用VQSR過(guò)濾？為什么不用VQSR過(guò)濾？
重測(cè)序分析（4）使用GATK進(jìn)行SNP和INDEL檢測(cè)
使用GATK進(jìn)行SNP和INDEL檢測(cè)GATK是 Broad 開(kāi)發(fā)的用于測(cè)序數(shù)據(jù)的變異檢測(cè)軟件，后續(xù)推廣到動(dòng)植物研究中，是目前最廣泛使用的變異檢測(cè)軟件。GATK有兩種方式變異...
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高級(jí)遺傳學(xué)筆記-單基因遺傳病
授課教師：宋書(shū)娟教授 一.分子遺傳學(xué)基本概念 DNA和基因 DNA概念等位基因基因型與表現(xiàn)型 單基因遺傳病概念 單基因遺傳?。和耆苫蛞蛩貙?dǎo)致，環(huán)境因素微乎其微遺傳?。河蛇z...
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骨髓的成分與細(xì)胞類型維基百科，網(wǎng)址：https://en.wikipedia.org/wiki/Bone_marrow[https://en.wikipedia.org/wiki/Bone_ma...
