我的2019年終總結(jié)木有寫，2020的大事又不多，不妨寫在一起吧。 2019年 2019年我以新人講師的角色隨團隊一起全國巡講，21場線下培訓我參加了19場，還有幾次本地開班...
發(fā)簡信
IP屬地：上海
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轉(zhuǎn)移陣地公告
我的所有文章都轉(zhuǎn)移到語雀，并持續(xù)更新。或者也可以在國民聊天軟件上搜索生信星球公眾號，或者簡信私聊找我要聯(lián)系方式。 我2018年下半年開始做知識分享，到現(xiàn)在已經(jīng)快三年了，都是在...
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RMarkdown基礎(chǔ)知識RMD方便整理筆記、輸出代碼，和.R文件不同，可以視為高級腳本 一、RMD組成 RMD由三部分組成：頭文件、代碼塊、正文1、頭文件：用---分割線和下面分開，其中output...
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從官網(wǎng)上下載TCGA數(shù)據(jù)不知從TCGA下了多少次數(shù)據(jù)了，每次都像失憶了一樣重新研究……果然凡事都該動筆記下來 TAT本次以肝癌數(shù)據(jù)為例操作系統(tǒng)：MAC OS 1. 登陸TCGA網(wǎng)站 https://...
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本號停更
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轉(zhuǎn)錄組分析——四、數(shù)據(jù)質(zhì)控
數(shù)據(jù)質(zhì)控：fastqcfastqc軟件可以對fastq格式的原始數(shù)據(jù)進行質(zhì)量統(tǒng)計，評估測序結(jié)果，為下一步修剪過濾提供參考 fastqc的常用參數(shù) -h 打印fastqc的幫...
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轉(zhuǎn)錄組分析——三、sra轉(zhuǎn)換成fastq一、背景知識 1、sra數(shù)據(jù) sra數(shù)據(jù)是SRA數(shù)據(jù)庫用于儲存二代測序數(shù)據(jù)的原始數(shù)據(jù)的一種壓縮格式，這種數(shù)據(jù)格式不能直接進行處理，需要轉(zhuǎn)換成fastq才能進行質(zhì)控以及去ada...
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轉(zhuǎn)錄組分析——二、數(shù)據(jù)完整性檢驗
一、md5值檢驗 md5值檢驗需要用到的東西1、一個txt文件（第一列為md5值，第二列為sra文件名，兩列中間有兩個空格，固定格式）2、下載好的sra文件3、txt文件和s...
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轉(zhuǎn)錄組分析——一、工作目錄搭建及SRA文件下載一、準備工作-目錄管理 一句命令同時創(chuàng)建多個同級別文件夾，規(guī)律存放，方便溯源幾個文件的作用分別為“軟件安裝，數(shù)據(jù)庫存放，流程搭建目錄，項目分析，數(shù)據(jù)備份” 二、數(shù)據(jù)下載 流程...
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歡迎關(guān)注公眾號簡寶玉( 公眾號ID : jianshu4321 )后臺回復“指南”獲取玩轉(zhuǎn)簡書絕密珍貴資料匯總；有問題，找寶玉。簡寶玉同志會專程為你答疑解惑關(guān)于簡書的一切。 有思想、有深度、有分享、有見解的熱點交流平臺，在這里你能尋找到全球最快最新最熱的熱點文章，在這里，放飛你的激情，透過心靈，尋找另一個自己。 專題主編：零露_清揚婉兮 http://www.itdecent.cn/u/e22026e54f34 投稿須知：http://www.itdecent.cn/p/675e55af0bf1
