??作為生命科學的從事者，不論是老師或者學生都應該用過NCBI((National Center for Biotechnology Information Search d...
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NCBI下載SRA數(shù)據(jù)的4種方法 -
seurat-ScaleData()源碼解析一、ScaleData()簡介 單細胞基因表達counts矩陣數(shù)據(jù)經(jīng)過NormalizeData()歸一化處理后，還需要進行scale標準化。ScaleData()[http...
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R使用筆記: ggplot2做boxplot的幾個細節(jié)本次筆記內(nèi)容：fill =的位置： ggplot(aes(fill = )) & geom_boxplot(fill = ) & geom_boxplot(aes(fill ...
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非靶向 | 靶向代謝組學數(shù)據(jù)分析總結(jié)-綱要@(Dayueban)[靶向|非靶向|代謝組學數(shù)據(jù)分析] 導讀 如今組學數(shù)據(jù)的產(chǎn)出量日益龐大。代謝組學數(shù)據(jù)也是如此，隨著科技的創(chuàng)新和技術(shù)的變革，允許科研工作者們通過大樣本數(shù)據(jù)...
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芯片數(shù)據(jù)和RNA-seq的差異分析流程由于太久沒有分析過bulk數(shù)據(jù)了，前幾天突然被要求分析一個文章的數(shù)據(jù)時有點亂了手腳，所以在這里想總結(jié)一下關(guān)于芯片數(shù)據(jù)與seq數(shù)據(jù)的差異分析流程。 假如你是小白，也剛剛了解NG...
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limma的坑
按照字母排序，誰排在后面誰是分子，排在前面為分母 GEO芯片分析中的大坑，差異基因完全相反！ GEO的芯片分析，可以看一下這一篇。最有誠意的GEO數(shù)據(jù)庫教程 GEO的芯片分析...
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單細胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實操軌跡分析系列： 單細胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
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表觀組學：call peak概念和MACS2算法原理，最簡明清晰的call peak一文通在諸如：ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq(m6A)、Cut&Tag中我們常常聽到一個詞Call Peak。Call Peak究竟是什么東西，得到的結(jié)果又...
