Smart-seq： Smart-seq2的前身是Smart-seq，它是首個用于單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的方法。Smart-seq的提出可以追溯到2012年，它的原理是通過在反轉(zhuǎn)錄...
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Smart-seq2(一)
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cellranger(三)
4.cellranger aggr[https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/...
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cellranger(二)
使用 cellranger提供了五個分析模塊用于分析單細胞轉(zhuǎn)錄組相關(guān)產(chǎn)品 1.cellranger mkfastq[https://support.10xgenomics.c...
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cellranger(一)
上一節(jié)我們學(xué)習(xí)了10X Genomics[http://bioschool.cn/omics/scrna/10x-genomics/]的測序原理，這節(jié)我們來看看如何使用官方推...
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Linux命令 grep
grep 是一個在Linux/Unix系統(tǒng)中用于搜索文本的強大命令。它通過正則表達式來匹配文本，并輸出包含匹配模式的行。以下是 grep 命令的基本用法和一些常見選項。 基本...
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欣欣向榮
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單細胞ATAC分析標準流程（詳細版）背景：單細胞ATAC分析流程介紹。 1.為什么做單細胞ATAC分析？ 單細胞轉(zhuǎn)錄組分析的是單細胞分辨率上不同細胞之間的轉(zhuǎn)錄組（mRNA）差異，由中心法則可以知道，生物發(fā)生的過...
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Trimmomatic數(shù)據(jù)質(zhì)控
生信分析中最常見的數(shù)據(jù)格式應(yīng)該就是fastq了。我們最初拿到的數(shù)據(jù)也是fastq格式。通常情況下，原始下機數(shù)據(jù)經(jīng)過拆分之后獲得的數(shù)據(jù)中會包含有低質(zhì)量、N(未知堿基)、接頭序列...
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生信技能樹新葉講師<br>這里是新葉的分身馬甲：信你個鬼<br>B站：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fspace.bilibili.com%2F2356770" target="_blank">https://space.bilibili.com/2356770</a><br>歡迎學(xué)習(xí)交流
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Linux命令 awk案例
使用的示例文件如下： 輸出指定列： 指定分隔符： 注：FS的優(yōu)先級高于-F，即同時指定-F和FS時會使用FS參數(shù) 插入字段： 解釋：默認-F參數(shù)為空白或者Tab鍵，1表示第一...
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Linux命令 awk
簡介 AWK[https://www.gnu.org/software/gawk/manual/gawk.html] 是一種處理文本文件的語言，是一個強大的文本分析工具。 之...
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Linux命令 vim
VIM 是 Linux 系統(tǒng)上一款文本編輯器(程序開發(fā)工具)，它是操作 Linux 的一款利器，由vi發(fā)展而來。 vim有三種模式，分別為命令模式（Command Mode）...
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個人公眾號:一杯仙氣<br><br>個人微信在公眾號可以找到，有問題可以問我哦～<br>誠意添加。<br><br>不甘與空氣平凡，就要如仙氣不凡。<br>歡迎關(guān)注，分享你的故事，我們一起成長。
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你是如何把一個微信公眾號運營到可以養(yǎng)活自己的？不看后悔系列?。。。。?！之杯子良心回答。 好吧，我終于來這個話題下，分享一下我的心路歷程。 向你保證所有此類內(nèi)容，收藏這一篇就夠了?。。?2018年五月開通了我自己的公眾號，...
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python數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和類型
數(shù)據(jù)類型 在Python中，有許多內(nèi)置的數(shù)據(jù)類型，包括但不限于以下幾種： 1.整數(shù)（int）: 表示整數(shù)，例如：x = 5。 2.浮點數(shù)（float）: 表示帶有小數(shù)點的數(shù)值...
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python安裝
本節(jié)開始，我們將詳細介紹Python編程環(huán)境的搭建，工欲善其事必先利其器，所以我們這里先介紹python詳細安裝教程。由于Python是跨平臺的，他可以運行在Windows、...
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python和生物信息
Python 是一種高級、通用、解釋型、面向?qū)ο蟮木幊陶Z言，由Guido van Rossum在1989年底和1990年初創(chuàng)建。以下是 Python 的一些關(guān)鍵特點和信息： ...
