AlphaGenome: advancing regulatory variant effect prediction with a unified DNA sequence...
發(fā)簡信
IP屬地：寧夏
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文獻(xiàn)分享——AlphaGenome: advancing regulatory variant effect prediction with a unified DNA sequence model -
p5和p7都有可能連接到flowcell上呀，您看一下示例圖
基礎(chǔ)知識——illumina測序原理
二、高通量測序---illumina測序原理 高通量測序技術(shù)（High-throughput sequencing）以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定和一般...
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基礎(chǔ)知識——連鎖不平衡 Linkage disequilibrium (LD)一、概念 連鎖不平衡是指,在某一群體中，分屬兩個或兩個以上基因座的等位基因同時出現(xiàn)在一條染色體上的幾率，高于隨機(jī)出現(xiàn)的頻率。連鎖不平衡是等位基因或者遺傳標(biāo)記在一個種群中表現(xiàn)出...
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常用GWAS統(tǒng)計(jì)方法和模型簡介本文是百邁客GWAS生物信息培訓(xùn)課程學(xué)習(xí)筆記第二篇，第一篇請參考GWAS基本分析內(nèi)容 這里首先介紹了GWAS分析中常用的統(tǒng)計(jì)學(xué)概念： 1. 假設(shè)檢驗(yàn) 零假設(shè)(H0,null ...
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軟件安裝——VMware安裝，創(chuàng)建Ubuntu虛擬機(jī)(Windows)part 1 VMware安裝 一、VMware簡介 VMware,lnc(Virtual Machine ware)是虛擬PC軟件公司，提供服務(wù)器，桌面虛擬化解決方案。 主...
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TiED:人類組織特異性增強(qiáng)子數(shù)據(jù)庫
歡迎關(guān)注”生信修煉手冊”! TiED是一個人類增強(qiáng)子數(shù)據(jù)庫，對10種不同組織中的增強(qiáng)子表進(jìn)行定量和分析，鑒定了增強(qiáng)子的組織特異性，網(wǎng)址如下 http://lcbb.swjtu...
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文獻(xiàn)分享——Chromatin interaction neural network (ChINN): a ...Chromatin interaction neural network (ChINN): a machine learning-based method for predi...
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基礎(chǔ)知識--增強(qiáng)子基礎(chǔ)知識--增強(qiáng)子 一、定義 增強(qiáng)子(Enhancer) 又可譯為強(qiáng)化子，是DNA上一小段可與蛋白質(zhì)結(jié)合的區(qū)域，與蛋白質(zhì)結(jié)合之后，基因的轉(zhuǎn)錄作用將會加強(qiáng)。增強(qiáng)子可能位于基因上...
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截取序列時截取等長片段
軟件學(xué)習(xí)——模體搜索MEME-ChIP
The MEME suite 是一組功能強(qiáng)大的，基于網(wǎng)頁的集成工具，可用于研究蛋白質(zhì)，DNA 和 RNA 中的序列模體。 The MEME Suitehttps://meme...
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Juicer:Hi-C數(shù)據(jù)處理分析（一）參考： [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop...
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科研繪圖軟件——Graphad PrismGraphad Prism(8.0) 一、軟件簡介 這是一款非常好用且功能強(qiáng)大的科研醫(yī)學(xué)生物數(shù)據(jù)處理繪圖軟件，也可對數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。 官方網(wǎng)站 https://www.gr...
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基礎(chǔ)知識——第三代測序技術(shù)三、第三代測序技術(shù) 一、單分子熒光測序 1.1測序平臺 Pacific Biosciences 公司，簡稱為PacBio,這是目前為止，讀長最長的下一代測序技術(shù)公司。 讀長最...
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基礎(chǔ)知識——Linux下常用命令
Linux下常用命令 目錄相關(guān)命令 命令 功能 pwd顯示當(dāng)前路徑mkdir創(chuàng)建空目錄ls顯示列表rm刪除文件rm -r刪除非空目錄rm -rf清空所有，謹(jǐn)慎使用cd進(jìn)入某...
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基礎(chǔ)知識——基因結(jié)構(gòu)基因（遺傳因子） 是產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA所需的全部核苷酸序列。帶有遺傳信息的DNA片段稱為基因。(百度百科)[https://baike.baidu.com/item/...
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基礎(chǔ)知識——illumina測序原理二、高通量測序---illumina測序原理 高通量測序技術(shù)（High-throughput sequencing）以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定和一般...
