說在前面： 早在 2009 年，韓斌團(tuán)隊(duì)（第一作者是黃學(xué)輝）就在 Genome Res 上發(fā)了一篇文章 High-throughput genotyping by whole...
IP屬地：四川
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SNPbinner 構(gòu)建定位群體的基因組 bin 圖譜 -
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言簡意賅
一套比較簡便的基因組組裝流程
這套流程主要特點(diǎn)是消耗資源比較少，1G以內(nèi)的基因組，內(nèi)存不要低于128G，最好能搞到256G，但是再多對(duì)這套流程用不上，更大的基因組沒有測(cè)試過。 測(cè)序數(shù)據(jù)為100x以上的Pa...
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使用Pandas合并多個(gè)表格
大家好，我是小劉歌。介紹一個(gè)使用Pandas合并多個(gè)表格的程序。廢話不多說，直接上代碼。 使用 mamba install -n base -c conda-forge pa...
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【GWAS】為TASSEL結(jié)果繪制曼哈頓圖及QQ圖好久沒寫博文了，分享一個(gè)為TASSEL結(jié)果繪制曼哈頓圖的代碼： 結(jié)果如下： QQ 圖的結(jié)果有點(diǎn)異常，請(qǐng)忽略。 歡迎大家大家關(guān)注「小劉哥」公眾號(hào)，進(jìn)行交流。
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@wanghaolin 就是你關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果
繪制 SNP 密度圖
一般使用 CMplot 繪制SNP密度圖：包鏈接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要繪制 SNP 密度圖，僅僅需要三列即可：a. 第...
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@小梁學(xué)生信 還沒寫哦
一步一步學(xué)會(huì)撰寫SNP Calling 流程（二）
3.1 DNASeq 數(shù)據(jù)分析SNP/Indel 策略 策略一： BWA + Samtools /Picard + GATK 1) BWA 比對(duì)及 Samtools 轉(zhuǎn)化為 ...
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@Vivian冉 就是標(biāo)記的染色體及物理位置。只需要示例數(shù)據(jù)中的前三列即可。
繪制 SNP 密度圖
一般使用 CMplot 繪制SNP密度圖：包鏈接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要繪制 SNP 密度圖，僅僅需要三列即可：a. 第...
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@Alexander_Le 多看看小駱駝書
實(shí)用便捷小程序--由從gff文件提取exon/intron坐標(biāo)信息
自己動(dòng)手，豐衣足食?？床欢?的留言，討論！
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@shwzhao 是根據(jù)exon提取的，可以設(shè)置的
實(shí)用便捷小程序--由從gff文件提取exon/intron坐標(biāo)信息
自己動(dòng)手，豐衣足食。看不懂 的留言，討論！
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@shwzhao 是的，gffread好的很
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