做完轉(zhuǎn)錄組分析之后，一般都要求做qRT-PCR來驗(yàn)證二代測序得到的轉(zhuǎn)錄本表達(dá)是否可靠。熒光定量PCR是一種相對表達(dá)定量的方法，他的計(jì)算方法有很多，常用的相對定量數(shù)據(jù)分析方法有...
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qRT-PCR相對定量計(jì)算詳解 -
Day 11 充分理解GSVA和GSEA單個(gè)基因集的GSEA分析 http://software.broadinstitute.org/gsea/msigdb/index.jsp GSEA官網(wǎng)列出關(guān)于msigdb基...
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腫瘤異質(zhì)性的背景知識(shí)
腫瘤異質(zhì)性定義： 腫瘤的異質(zhì)性是惡性腫瘤的特征之一，是指腫瘤在生長過程中，經(jīng)過多次分裂增殖，其子細(xì)胞呈現(xiàn)出分子生物學(xué)或基因方面的改變，從而使腫瘤的生長速度、侵襲能力、對藥物的...
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艾滋病是如何從非洲黑猩猩傳給人，進(jìn)而傳向全世界的？據(jù)說艾滋病最早出現(xiàn)在非洲大猩猩身上，怎么傳到人身上了呢？ 艾滋病（AIDS）病毒（HIV）屬于慢病毒這個(gè)大家族的成員，慢病毒可以引起包括牛、馬、綿羊、貓科動(dòng)物和靈長類等各種哺...
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第30周-乳腺癌病人的原位癌多點(diǎn)采樣測序看異質(zhì)性
乳腺癌病人的原位癌多點(diǎn)采樣測序看異質(zhì)性 于2015年發(fā)表在 Nature Medicine雜志，標(biāo)題是：Subclonal diversification of primar...
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火起來的“相分離”是什么？相分離或者說相變（Phase separation，Phase Transition）是目前比較火的一個(gè)研究領(lǐng)域，已有的研究表明相分離在細(xì)胞中普遍存在，與基因組的組裝、轉(zhuǎn)錄調(diào)...
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從葛優(yōu)到美國隊(duì)長到底有多遠(yuǎn)？瘦子做到這3點(diǎn)，也能變成肌肉男！瘦夠了！排骨精別總羨慕肌肉男，做到這3點(diǎn)，你也能練出肌肉 去健身房里你能看到形形色色的人，有胖的，有瘦的，胖子要減脂，瘦子要增肌，每個(gè)人都有自己的目的。 但相比而言，胖子減脂...
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高通量測序數(shù)據(jù)處理學(xué)習(xí)記錄（二）：Read Counts的提取high-throughput seq analysis急先鋒——HTSeq的使用介紹 在所有物是人非的景色里，我最中意你。 正體 HTSeq作為一款可以處理高通量數(shù)據(jù)的py...
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轉(zhuǎn)錄組入門（2）：讀文章拿到測序數(shù)據(jù)本系列課程學(xué)習(xí)的文章是：AKAP95 regulates splicing through scaffolding RNAs and RNA processing facto...
