宏基因組和16s的相關(guān)分析流程、方法、所用工具
發(fā)簡信
IP屬地：上海
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微生物宏基因組
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微生物組16S rRNA數(shù)據(jù)分析小結(jié): qiime2-2019.1本次筆記內(nèi)容：qiime2-2019.1的16s分析流程，以沒有barcode，以demultiplexed的fastq文件為input.同微生物組16S rRNA數(shù)據(jù)分析小...
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歡迎大家分享自己在完成生信技能樹linux作業(yè)時(shí)的筆記心得 。 生信人的 linux 20題 <http://www.bio-info-trainee.com/2900.html 處理 fastq,fasta,sam,bam,vcf,gff,gtf,bed,MAF等**格式（約定成俗，大牛推廣）**的數(shù)據(jù) fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí) http://www.bio-info-trainee.com/3575.html sam和bam格式文件的shell小練習(xí) http://www.bio-info-trainee.com/3578.html VCF格式文件的shell小練習(xí) http://www.bio-info-trainee.com/3577.html
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生信技能樹，生信菜鳥團(tuán)，jimmy
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學(xué)習(xí)小組Day7筆記--五顆糖1.思維導(dǎo)圖 2. 一代測(cè)序 sanger法測(cè)序（“雙脫氧終止反應(yīng)法”，觀看）：顧名思義，DNA在聚合酶的作用下進(jìn)行無數(shù)次合成，每次到了ddNTP就終止，這樣就得到不同長度的...
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學(xué)習(xí)小組Day6筆記--五顆糖
1.R包的安裝 首先install.packages(“包”)如果包不好安裝可以下載壓縮文件進(jìn)行本地安裝。然后選擇鏡像最后（二者選一個(gè)）library(包) require(...
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學(xué)習(xí)小組Day5筆記--五顆糖1.思維導(dǎo)圖 2.R中5類數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 向量 （vector）：最簡單的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)如c(1,2,3)或者c("a","b")都是向量。矩陣（Matrix）：這里的矩陣和線性代數(shù)中的...
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學(xué)習(xí)小組Day4筆記--五顆糖
1.寫在前面的話 我對(duì)于R語言的學(xué)習(xí)，大概起步于三四年前，科研上的畫圖確實(shí)離不開R，畫圖很好看，特別在統(tǒng)計(jì)分析那一塊，R語言的優(yōu)勢(shì)是很大的，一些R包的使用也非常方便快捷，但長...
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學(xué)習(xí)小組Day3筆記--五顆糖1. Linux系統(tǒng)下軟件的安裝-入門 linux的應(yīng)用商店conda的安裝conda可以為Linux系統(tǒng)下安裝軟件提供一個(gè)平臺(tái)，需要的軟件可以從中搜索并安裝，因此我們需要先...
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《學(xué)習(xí)小組Day2筆記--五顆糖》1.思維導(dǎo)圖 2.登陸Linux 下載Putty軟件進(jìn)行遠(yuǎn)程登陸（需要用戶名和密碼）登錄系統(tǒng)后的界面 3.Linux常用基本命令 顯示當(dāng)前路徑：pwd （print work...
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Day1—zlm
1 什么是Markdown？ Markdow是一種純文本格式語法的輕量級(jí)標(biāo)記語言（ lightweight markup language），具體描述可見維基百科。 2 Ma...
