主成分分析(Principal component analysis,PCA)是將多個(gè)存在相關(guān)關(guān)系的變量,降維為幾個(gè)互不相關(guān)的指標(biāo),也就是主成分。我的數(shù)據(jù)相對(duì)來說,有點(diǎn)復(fù)雜,...
主成分分析(Principal component analysis,PCA)是將多個(gè)存在相關(guān)關(guān)系的變量,降維為幾個(gè)互不相關(guān)的指標(biāo),也就是主成分。我的數(shù)據(jù)相對(duì)來說,有點(diǎn)復(fù)雜,...
本文轉(zhuǎn)載自:Bionifarmer[https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/14375487.html]。個(gè)人感覺非常好。如有侵權(quán),請(qǐng)聯(lián)系我。...
回顧上一次的一個(gè)OLS, GLS,SI, MME的發(fā)展示意圖: MME是Henderson將混合模型的轉(zhuǎn)換得到 1 MME的起源 Henderson提出,其想法是結(jié)合OLS與...
啟動(dòng) docker(啟動(dòng)前肯定是先進(jìn)行 docker 安裝和 liunux 環(huán)境的下載,如需本步,下次進(jìn)行介紹) 創(chuàng)建鏡像并創(chuàng)建新用戶 安裝必要基礎(chǔ)軟件 安裝 blast 并...
從前,有個(gè)頭腦靈活的財(cái)主,將自己的財(cái)產(chǎn)托付給三位信得過的仆人保管和運(yùn)用。 他把財(cái)產(chǎn)分成8份,給了第一位仆人5份,第二位仆人2份,第三位仆人1份。 財(cái)主告訴這三位仆卜,要好好珍...
可以說這是一本創(chuàng)業(yè)指導(dǎo)書,提供了創(chuàng)業(yè)前需要思考的幾個(gè)問題: 具體細(xì)節(jié): 1. 未來的挑戰(zhàn) 2. 像 1999 年那樣狂歡-4 點(diǎn)經(jīng)驗(yàn) 3. 所有成功的企業(yè)都是不同的 4. 競(jìng)...
linux系統(tǒng)中默認(rèn)沒有中文字體,進(jìn)行網(wǎng)頁(yè)設(shè)計(jì)或者報(bào)告設(shè)計(jì)時(shí)需要對(duì)字體進(jìn)行設(shè)置,這時(shí)很多時(shí)候需要添加中文字體 首先,可以使用fc-list查看現(xiàn)在的字體image.png 如...
使用cpanm進(jìn)行安裝cpanm本身是個(gè)文件,地址:https://raw.githubusercontent.com/miyagawa/cpanminus/master/c...
已有的工具如circos, 只能繪制彎的染色體,又如R包c(diǎn)hromoMap,IdeoViz,karyploteR,ggbio和在線工具Idiographica,雖然能繪制直的...
參考文章:http://www.itdecent.cn/p/07ae1fe18071需求描述:我想繪制差異表達(dá)基因在染色體上的分布,或開放染色質(zhì)在染色體上的分布或CTCF在...
??測(cè)序深度的分布圖是很常見的一類圖,可用于發(fā)現(xiàn)染色體片段或整條染色體的缺失或是重復(fù)。如果是缺失,測(cè)序時(shí)捕獲的概率就小,最終比對(duì)呈現(xiàn)出來的就是有一段區(qū)域深度明顯偏低;如果是重...
有兩種方法,先看比較簡(jiǎn)單的一種: 結(jié)果: 第二種方法就比較復(fù)雜了,需要準(zhǔn)備兩個(gè)文件:一個(gè)是包含染色體長(zhǎng)度的文件chr_length.txt,格式如下: 一個(gè)是包含各個(gè)基...
之前有一次,我導(dǎo)說“能不能把這些基因按順序畫在果蠅的染色體上”,因此,我尋找了一些實(shí)現(xiàn)這個(gè)需求的方法。經(jīng)過一番奇奇怪怪的操作之后,最終用ggplot2畫了。。。其它方法簡(jiǎn)單地...
創(chuàng)建組 創(chuàng)建用戶 -u 1006 指定id 適用于已經(jīng)創(chuàng)建過用戶,再是系統(tǒng)重裝等原因造成的需要重新創(chuàng)建賬號(hào),保持與原始的記錄一致 -d 指定目錄結(jié)構(gòu) -g 指定歸屬組 最后設(shè)...
生成公鑰 ssh-keygen -t rsa 不改名字 生成 注意:.ssh目錄的權(quán)限必須是700.ssh/authorized_keys文件權(quán)限必須是600上述操作必須在兩...
Genome-wide association mapping reveals a rich genetic architecture of complex traits in Oryza sativa
11年的NC 的文章
群體進(jìn)化-GWAS分析群體進(jìn)化-gwas分析 群體進(jìn)化基礎(chǔ)分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis),即主成分分析方法,是一種使用最廣泛的數(shù)據(jù)...
你好,咱這個(gè)劃 bin 的代碼有文獻(xiàn)可引用或者基于那篇文章來的呢?
binmap-123原網(wǎng)址:1)http://www.jintiankansha.me/t/etiz287dU8 2)http://www.jintiankansha.me/t/i81Con4f...