研究生在讀，植物病原真菌致病基因功能解析&生信分析~歡迎相互交流，共同進步。
發(fā)簡信
IP屬地：安徽
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BLAST（序列相似性快速搜索工具）1. 什么是BLAST？ BLAST的全稱是Basic Local Alignment Search Tool（基本的局部比對搜索工具），基于一種局部最優(yōu)的比對策略。 BLA...
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分子進化筆記（四）: MEGA5構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹本文轉(zhuǎn)載自http://blog.sina.com.cn/s/blog_5eb2fefb0101gny0.html 1．準備序列文件 準備fasta格式序列文件（fasta格...
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Transcript ID（ENST/ENSMUST/NM_123456）轉(zhuǎn)換為gene ID（ENSG/ENSMUSG/Gene ID）和Gene name/Symbol----前不久拿到公司給的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果，Gene ID是以ENMUST開頭，查了一下，ENST為EMBL 核酸數(shù)據(jù)庫中人類的轉(zhuǎn)錄本ID，ENMUST為鼠的轉(zhuǎn)錄本ID。一般我...
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使用SMART預測新型冠狀病毒2019-nCoV的結(jié)構(gòu)
歡迎來到"bio生物信息"的世界 有很多的工具可以預測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，比如我之前寫過的三篇文章： 1）蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模型和功能預測：Swiss-model工具的使用：https://...
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生信 SMART --使用介紹SMART 簡介----蛋白序列功能域分析 simple modular architecture research tool Smart官網(wǎng)：http://smart.em...
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<br>自學生信的小白，<br>生物屆的一只單身狗!<br><br>從爬蟲過來的蛇友！
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前言科學-3D2Y<br><br>簡書博客<br><a href="http://www.itdecent.cn/u/599a9e91afc8" rel="nofollow" target="_blank">http://www.itdecent.cn/u/599a9e91afc8</a><br><br>CSDN博客<br><a href="https://blog.csdn.net/leadingsci" rel="nofollow" target="_blank">https://blog.csdn.net/leadingsci</a><br><br>微店：<br><a href="https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile" rel="nofollow" target="_blank">https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile</a>
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蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預測、結(jié)果解讀與評分蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預測，只要有目的基因的氨基酸序列就可以做，不限物種，沒有太多要求，可為文章增色。windows版本的VMD軟件可在公眾號生信星球回復“VMD”獲得，且附帶軟件中...
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5?? 蛋白質(zhì)序列基本和特征信息分析(1) :蛋白質(zhì)序列基本信息分析(氨基酸組成，理化性質(zhì)，親疏水等)[序列比對和序列特征分析總目錄](http://www.itdecent.cn/p/878f2b2495ae 蛋白質(zhì)是生命功能的執(zhí)行者，一切生命活動都與蛋白質(zhì)有關(guān)。我們知道...
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生物數(shù)據(jù)庫
生物數(shù)據(jù)庫 基本序列格式 1.FASTA格式：首行為描述行，以>為起始，其后為描述信息；第二行即為原始序列。2.FASTQ格式:FASTQ格式包括四部分信息：第一行為包含序列...
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在線預測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)PyMOL 蛋白質(zhì)是生命活動的體現(xiàn)者，其結(jié)構(gòu)決定著功能。由線性氨基酸組成的蛋白質(zhì)需要折疊成特定的空間結(jié)構(gòu)才具有相應(yīng)的生理活性和生物學功能。 解析蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)...
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蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析一點小心得這幾天忙著寫一個前列腺癌蛋白標記相關(guān)的小報告，惡補前列腺癌相關(guān)的知識和這個蛋白特性，學找分析這個蛋白質(zhì)的特性（包括分子量、等電點、氨基酸組成、跨膜域、信號肽、疏水性和結(jié)構(gòu)功能...
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生物信息學數(shù)據(jù)庫及在線工具匯總 （更新）
核酸數(shù)據(jù)庫 NCBI [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/]NCBI (National Center for Biotechnolo...
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構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建 現(xiàn)有的方法 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建方法的優(yōu)劣 link 選擇：一般情況下，若有合適的分子進化模型可供選擇，用最大似然法構(gòu)樹獲得的結(jié)果較好；對于近緣物種序列，通常情況...
