首先非常感謝Cj大神開發(fā)出來的TBtools生信工具，為生信分析做圖帶來了極大的便利。作為生信小白，在做多物種間共線性分析時，嘗試了多種方法，苦于沒有計算機基礎，一直沒能完成...
發(fā)簡信
IP屬地：上海
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零基礎多物種間共線性分析 -
用TBtools，快速高效實現(xiàn)基因組共線性分析與可視化， 贊！寫在前面 對于沒有做過共線性分析的小伙伴，可以通過以下幾段內(nèi)容，了解一下，我為什么要費勁巴拉畫出這樣一張圖。 除了基因組成的相似性,在不同基因組中基因排列順序的一致性更能夠體...
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『文獻閱讀』REViGO
文獻：REVIGO Summarizes and Visualizes Long Lists of Gene Ontology Terms 發(fā)表年份：Received Mar...
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Chip-Seq 分析過程二全文分析流程學習按照：九月學徒ChIP-seq學習成果展 一、 怎么將SAR文件轉(zhuǎn)為fastq文件？ 1. 【方法】利用軟件sratoolkit，下載后解壓，找到其中的 f...
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轉(zhuǎn)錄組分析實戰(zhàn)第四節(jié)：轉(zhuǎn)錄組分析中的技術(shù)重復和生物學重復檢查前期的到的基因表達量矩陣，可以得到每個基因的表達量，然而由于我們在做實驗過程中的重復（包括技術(shù)重復與生物學重復）理論上來講是可以保持表達量在重復中的一致性。因此我們也可通過這...
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Cytoscape + STRING + cytoHubba 聯(lián)合使用尋找hub基因今天是不用學代碼利用生信軟件聯(lián)合“點點點”就可以取得hub基因的“白癡”實操，趕快點起來～ Hub基因（關(guān)鍵基因）是在生物學過程中發(fā)揮重要作用的基因，它往往在通路中為主導地位...
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把基因畫在染色體上之前有一次，我導說“能不能把這些基因按順序畫在果蠅的染色體上”，因此，我尋找了一些實現(xiàn)這個需求的方法。經(jīng)過一番奇奇怪怪的操作之后，最終用ggplot2畫了。。。其它方法簡單地...
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如何下載感興趣的基因集（GO數(shù)據(jù)庫）
需求：下載DNA損傷修復相關(guān)的基因列表。 第一步 搜索數(shù)據(jù)庫 進入GO (Gene Ontology) 數(shù)據(jù)庫網(wǎng)頁 http://geneontology.org/ ，在搜索...
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基因測序原理——以BGISEQ-500為例
首先聲明，作為大學時的生物狗和工作時的挨踢狗，實非基因測序的專業(yè)人士。 再說說寫這篇文章的緣由，華大基因的BGISEQ-500?，自從15年10月發(fā)布會以來，就鮮有報道，但作...
