古希臘的自然觀泰勒斯：水是世界的本原。 即萬物的開端、開始和起源是水；水是生命的本原，滲透在萬事萬物之中，使得宇宙成為有機(jī)體。 畢達(dá)哥拉斯：把數(shù)當(dāng)作世界的本原，主張“萬物皆數(shù)...
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自然辯證法考試四道題的資料
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解決 Linux 和 Windows 雙啟動帶來的時(shí)間同步問題編譯自：http://www.theitstuff.com/how-to-sync-time-between-linux-and-windows-dual-boot-2作者：...
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Gromacs參數(shù)文件md.mdp翻譯詳解
AspirinCode：點(diǎn)擊打開鏈接 官網(wǎng)：點(diǎn)擊打開鏈接 李老師博客：點(diǎn)擊打開鏈接 蛋白質(zhì)配體復(fù)合物模擬md運(yùn)行過程中需要用到輸入文件md.mdp，現(xiàn)對里面的各種編輯項(xiàng)目做簡...
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轉(zhuǎn)-層析
文 南京大學(xué) 楊榮武教授 層析在蛋白質(zhì)分離純化中是不可替代的一種方法，早在1903年，層析法就被俄國植物學(xué)家Mikhail Tswett 用來分離植物色素，因此又稱為色譜。所...
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計(jì)算PCA和FEL
平衡軌跡all.trr: 25000-50000 50-100ns不要隔幀取 先用 選擇蛋白質(zhì)的alpha碳，和核酸的磷。把PCA用到的index得到，保存為PCA.ind...
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How to find my TeamViewer ID on SSH?
Set your password first: And the run: It will show you the TeamViewer ID.
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轉(zhuǎn)-Teamviewer ubuntu 提示 TeamViewer Daemon is not running
Ubunut 12.04下面安裝了Teamviewer，剛安裝完啟動是沒有問題的，每次重啟打開就會提示： "TeamViewer Daemon is not running ...
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Linux 小知識翻譯 - 「SCP和SFTP」
wang_yb 這次想說說「SCP和SFTP」。 不管SCP還是SFTP，都是SSH的功能之一。都是使用SSH協(xié)議來傳輸文件的。 不用說文件內(nèi)容，就是登錄時(shí)的用戶信息都是經(jīng)過...
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Cas9蛋白的兩個結(jié)構(gòu)域的作用
Cas9蛋白包含的HNH核酸酶結(jié)構(gòu)域負(fù)責(zé)切割外源DNA與間隔序列互補(bǔ)的鏈，而RuvC結(jié)構(gòu)域負(fù)責(zé)切割外源DNA的另一條鏈。而且Cas9蛋白可以方便地將核酸酶改造為切口酶（nic...
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用NAMD軌跡文件算mmpbsa
為安裝PyTopol做準(zhǔn)備，先安裝pip要先安裝python,以及easy_install，再安裝pip 安裝PyTopolpip install pytopol 安裝完P(guān)y...
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error: 'cout' was not declared in this scope
Linux下C++編譯出錯原因解析 程序： 編譯出錯：$ g++ s.cpp -o s.outs.cpp: In function 'int main(int, char**...
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分子模擬DCD文件去水
去掉水的步驟： 在VMD Tk consle中先用 把蛋白質(zhì)和DNA的index得到，保存為protein_DNA.ind 然后在終端中用./catdcd -o XXX-no...
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轉(zhuǎn)-NAMD中原子速度過快的問題
能量最小化不夠，增加minimize的步數(shù)。能量最小化3000步一般是足夠的，不必把能量最小化至收斂的情況，那樣意義不大。消除一些明顯不合理的構(gòu)象就足矣。 能量最小化已經(jīng)充分...
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轉(zhuǎn)-VMD中的向量操作
set vec1 { 1 2 3}set vec2 {9 8 7} 以上是兩個要操作的向量加法：vecadd $vec1 $vec2 #輸出結(jié)果為 10 10 10減法：ve...
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C4.5的增益率準(zhǔn)則
需要注意的是，增益率準(zhǔn)則對可取值數(shù)目較少的屬性有所偏好，因此，C4.5算法并不是直接選擇增益率最大的候選劃分屬性，而是使用了一個啟發(fā)式： 先從候選劃分屬性中找出信息增益高于平...