IP屬地：上海
-
個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
-
收集一些R語言相關的報錯和解決方案。如果有些問題你無法處理，歡迎整理問題發(fā)送到xuzhougeng@163.com
-
CentOS上由libgfortran.so.4引起的R包igraph安裝問題
在R發(fā)布了3.6.1之后，我在我的CentOS服務器上編譯了這個版本的R語言，隨后就是開始安裝各種R包。在安裝clusterProfiler時，其中的一個R包igraph安裝...
-
本小推車專門推各種perl相關的基本語法介紹，資源，應用。特別是與生物信息學應用相關的文章。 ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進行查看。 ?? perl基本語法，比如和python語法的區(qū)別 ?? perl上下文，比如將列表賦值給標量會發(fā)生什么 ?? perl特殊變量，比如$_ $/ $\ ?? perl入門，比如循環(huán)，常見的正則使用等 ?? perl進階，比如引用，比如map grep等 ?? perl高級，比如命名空間，繼承，閉包等 ?? perl的單行程序，比如與linux的各個工具搭配 ?? perl常用模塊，比如File::Basename Yaml ?? perl繪圖，比如svg模塊，GD模塊，circos工具等等 ?? perl與生物信息學之間的關系，比如用perl提取genbank ?? perl6的相關用法（生信不太建議學perl6） 備注：本文很多的文章也可在 JSON_NULL 的專題 『碼神之路：perl篇』 中找到。這個專題對我的幫助很大，感謝這位簡友
-
生信~一天學會Perl，你相信嗎？劉小澤開始寫于19.7.31寫這個是因為看到龍星教程使用了大量的perl腳本，動輒4、5千行，例如https://github.com/WGLab/PennCNV/blob/...
-
轉錄組學習四（參考基因組及gtf注釋探究）
轉錄組學習一（軟件安裝） 轉錄組學習二（數(shù)據(jù)下載） 轉錄組學習三（數(shù)據(jù)質控） 轉錄組學習四（參考基因組及gtf注釋探究） 轉錄組學習五（reads的比對與samtoo...
-
RNA-seq練習 第二部分（基因組序列下載，注釋文件下載，索引下載，比對，比對質控,HTseq-count計數(shù)，輸出count矩陣文件）參考基因組下載有三大全文網(wǎng)站提供參考基因組下載，它們分別是：1.NCBI （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/grc）2.UCSC (http://h...
-
2019-06-27 scenic: single-cell regulatory network inference and clustering
title：scenic: single-cell regulatory network inference and clustering journal：Nature me...
-
作為生信菜鳥，雖然之前用 R 畫了不少圖，但經(jīng)常是現(xiàn)用現(xiàn)學，感覺 R 的知識不系統(tǒng)，之后系統(tǒng)的學習一下 R 語言。在這里把讀書筆記整理出來，入門書籍包括《R 語言編程藝術》、《ggplot2：數(shù)據(jù)分析與圖形藝術》、《R 語言實戰(zhàn)》、《R 語言與 Bioconductor 生物信息學應用》。
-
記錄數(shù)據(jù)分析過程中遇到的那些讓我漲知識的坑，生信札記
