前一篇推送解讀了2022年發(fā)表在DC上的關(guān)于擬南芥再生的文章。文章種利用TOBIAS鑒定了轉(zhuǎn)錄因子的活性。本次推送將介紹這款軟件的原理及使用。 TOBIAS——2020NC ...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖南
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生信分析7：如何利用ATAC-seq數(shù)據(jù)鑒定轉(zhuǎn)錄因子活性 -
sctransform通過(guò)仿射變化對(duì)單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化參考文獻(xiàn)鏈接：《Normalization and variance stabilization of single-cell RNA-seq data using regu...
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利用AUC來(lái)評(píng)估scRNA相同細(xì)胞類(lèi)型在兩個(gè)處理組別的差異前言 讀《Cell type prioritization in single-cell data》[https://www.nature.com/articles/s415...
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評(píng)估單細(xì)胞數(shù)據(jù)融合效果
前言 本文，作者利用局部逆辛普森系數(shù)評(píng)估harmony整合兩套單細(xì)胞數(shù)據(jù)的效果，作者利用局部逆辛普森系數(shù)評(píng)估了harmony整合不同批次單細(xì)胞數(shù)據(jù)的效果 摘自《Fast, s...
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人是環(huán)境的產(chǎn)物每天學(xué)點(diǎn)時(shí)間管理！ R:用90天來(lái)改變自己，加入一些圈子. C:上半年組織了幾場(chǎng)打卡學(xué)習(xí)的活動(dòng)，一開(kāi)始沒(méi)有想到會(huì)有些什么太大的收獲，但是一個(gè)月又一個(gè)月的堅(jiān)持下來(lái)之后發(fā)現(xiàn)，群里...
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基因表達(dá)趨勢(shì)分析-2：Mfuzz基因表達(dá)趨勢(shì)分析-1：TCseq[http://www.itdecent.cn/p/b808085c7351] Mfuzz能夠識(shí)別表達(dá)譜的潛在時(shí)間序列模式，并將相似模式的基...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組及空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)資源
(1). 單細(xì)胞上游軟件cellranger：?jiǎn)渭?xì)胞上游軟件cellranger從頭說(shuō)[http://www.itdecent.cn/p/9a09f7ad9d93] (2)...
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利用共表達(dá)的方法尋找兩個(gè)物種中表達(dá)保守的基因
依然是這篇文章《A comparative encyclopedia of DNA elements in the mouse genome》[https://www.nat...
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文章匯總--持續(xù)更新
總結(jié) 總結(jié)一些這一段時(shí)間在平臺(tái)上流水賬式的記錄和分享，也感謝各路大神，同行給的一些支持，我寫(xiě)的文章本來(lái)是記錄給我自己看的，沒(méi)想到也有很多朋友從中受益，這是我都榮幸。未來(lái)方便大...
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在
《Python網(wǎng)絡(luò)爬蟲(chóng)與信息提取》課程學(xué)習(xí)筆記
寫(xiě)在前面 到最后，你會(huì)明白。使用工具，不僅僅是人與動(dòng)物的區(qū)別，事實(shí)上，也是人與人的區(qū)別。甚至，有一些人會(huì)把其他人當(dāng)做工具。無(wú)論如何，我們都慢慢明白，一個(gè)人出成果并不是他自身能...
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感覺(jué)從科研里泡久了，也可以泡出來(lái)哲學(xué)。
《Python網(wǎng)絡(luò)爬蟲(chóng)與信息提取》課程學(xué)習(xí)筆記
寫(xiě)在前面 到最后，你會(huì)明白。使用工具，不僅僅是人與動(dòng)物的區(qū)別，事實(shí)上，也是人與人的區(qū)別。甚至，有一些人會(huì)把其他人當(dāng)做工具。無(wú)論如何，我們都慢慢明白，一個(gè)人出成果并不是他自身能...
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《Python網(wǎng)絡(luò)爬蟲(chóng)與信息提取》課程學(xué)習(xí)筆記寫(xiě)在前面 到最后，你會(huì)明白。使用工具，不僅僅是人與動(dòng)物的區(qū)別，事實(shí)上，也是人與人的區(qū)別。甚至，有一些人會(huì)把其他人當(dāng)做工具。無(wú)論如何，我們都慢慢明白，一個(gè)人出成果并不是他自身能...
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讀出了作者的溫情
凌晨的長(zhǎng)沙火車(chē)站
偶然機(jī)會(huì)，買(mǎi)了凌晨3.30回家的車(chē)票，長(zhǎng)沙—魯山，軟臥。 算起來(lái)這是我第一次坐凌晨的火車(chē)。 這個(gè)點(diǎn)不上不下的，睡覺(jué)也不踏實(shí)。心想，索性就不睡了，在夜晚長(zhǎng)沙的街道上走一走也別有...
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凌晨的長(zhǎng)沙火車(chē)站偶然機(jī)會(huì)，買(mǎi)了凌晨3.30回家的車(chē)票，長(zhǎng)沙—魯山，軟臥。 算起來(lái)這是我第一次坐凌晨的火車(chē)。 這個(gè)點(diǎn)不上不下的，睡覺(jué)也不踏實(shí)。心想，索性就不睡了，在夜晚長(zhǎng)沙的街道上走一走也別有...
