前一篇推送解讀了2022年發(fā)表在DC上的關(guān)于擬南芥再生的文章。文章種利用TOBIAS鑒定了轉(zhuǎn)錄因子的活性。本次推送將介紹這款軟件的原理及使用。 TOBIAS——2020NC ...
發(fā)簡信
IP屬地：湖南
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生信分析7：如何利用ATAC-seq數(shù)據(jù)鑒定轉(zhuǎn)錄因子活性 -
sctransform通過仿射變化對單細(xì)胞數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化參考文獻(xiàn)鏈接：《Normalization and variance stabilization of single-cell RNA-seq data using regu...
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利用AUC來評估scRNA相同細(xì)胞類型在兩個處理組別的差異前言 讀《Cell type prioritization in single-cell data》[https://www.nature.com/articles/s415...
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評估單細(xì)胞數(shù)據(jù)融合效果
前言 本文，作者利用局部逆辛普森系數(shù)評估harmony整合兩套單細(xì)胞數(shù)據(jù)的效果，作者利用局部逆辛普森系數(shù)評估了harmony整合不同批次單細(xì)胞數(shù)據(jù)的效果 摘自《Fast, s...
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人是環(huán)境的產(chǎn)物每天學(xué)點(diǎn)時間管理！ R:用90天來改變自己，加入一些圈子. C:上半年組織了幾場打卡學(xué)習(xí)的活動，一開始沒有想到會有些什么太大的收獲，但是一個月又一個月的堅(jiān)持下來之后發(fā)現(xiàn)，群里...
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基因表達(dá)趨勢分析-2：Mfuzz基因表達(dá)趨勢分析-1：TCseq[http://www.itdecent.cn/p/b808085c7351] Mfuzz能夠識別表達(dá)譜的潛在時間序列模式，并將相似模式的基...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組及空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)資源
(1). 單細(xì)胞上游軟件cellranger：單細(xì)胞上游軟件cellranger從頭說[http://www.itdecent.cn/p/9a09f7ad9d93] (2)...
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利用共表達(dá)的方法尋找兩個物種中表達(dá)保守的基因
依然是這篇文章《A comparative encyclopedia of DNA elements in the mouse genome》[https://www.nat...
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文章匯總--持續(xù)更新
總結(jié) 總結(jié)一些這一段時間在平臺上流水賬式的記錄和分享，也感謝各路大神，同行給的一些支持，我寫的文章本來是記錄給我自己看的，沒想到也有很多朋友從中受益，這是我都榮幸。未來方便大...
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在
《Python網(wǎng)絡(luò)爬蟲與信息提取》課程學(xué)習(xí)筆記
寫在前面 到最后，你會明白。使用工具，不僅僅是人與動物的區(qū)別，事實(shí)上，也是人與人的區(qū)別。甚至，有一些人會把其他人當(dāng)做工具。無論如何，我們都慢慢明白，一個人出成果并不是他自身能...
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感覺從科研里泡久了，也可以泡出來哲學(xué)。
《Python網(wǎng)絡(luò)爬蟲與信息提取》課程學(xué)習(xí)筆記
寫在前面 到最后，你會明白。使用工具，不僅僅是人與動物的區(qū)別，事實(shí)上，也是人與人的區(qū)別。甚至，有一些人會把其他人當(dāng)做工具。無論如何，我們都慢慢明白，一個人出成果并不是他自身能...
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《Python網(wǎng)絡(luò)爬蟲與信息提取》課程學(xué)習(xí)筆記寫在前面 到最后，你會明白。使用工具，不僅僅是人與動物的區(qū)別，事實(shí)上，也是人與人的區(qū)別。甚至，有一些人會把其他人當(dāng)做工具。無論如何，我們都慢慢明白，一個人出成果并不是他自身能...
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