DESeq2在R-studio上的安裝非常讓人自閉，具體可參考徐洲更老師的R語言安裝介紹https://www.bilibili.com/video/BV19p4y1i7Zb...
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DESeq2安裝避坑
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— circlize 基因組高級繪圖軌跡函數(shù) 1. Ideograms 在前面的例子中，我們使用 circos.initializeWithIdeogram() 函數(shù)來初始化圓形繪圖并添加染色體圖形（ideog...
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ggplot2繪制獨(dú)特的分面圖本節(jié)來介紹如何使用ggplot2自定義繪制分面并添加統(tǒng)計(jì)信息,以及單分面數(shù)據(jù)注釋 加載R包 繪制并排箱線圖 通常geom_boxplot函數(shù)繪制的箱線圖都是不帶誤差線的，在此...
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樹莓派綜合項(xiàng)目3：AI視覺機(jī)械臂小車（四）紅外避障一、介紹 ??樹莓派綜合項(xiàng)目3：AI視覺機(jī)械臂小車（一）蜂鳴器[http://www.itdecent.cn/p/58aebf35a315]??樹莓派綜合項(xiàng)目3：AI視覺機(jī)...
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— ggplot 統(tǒng)計(jì)圖層前言 雖然我們介紹了這么多節(jié)的 ggplot2，我們在繪制圖層時(shí)基本上使用的都是 geom_*() 函數(shù)，卻很少使用 stat_*() 函數(shù)。 當(dāng)然，使用 geom_*() ...
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基因家族分析(2) ggplot2繪制motif分析圖隔了這么長時(shí)間終于開始更新基因家族的第2篇文檔了，繪制motif分析圖。以往做這類分析都是通過TBtools此款軟件，今天讓我們通過ggplot2來繪制一個(gè)更加富有美感的mo...
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基因家族分析(4)ggtree繪制高端進(jìn)化樹系統(tǒng)發(fā)育樹幾乎是基因家族文章的必備圖，一個(gè)好看的樹圖的確能給文章增色不少，一般的用戶可能只使用MEGA繪圖，進(jìn)階一點(diǎn)的便會(huì)使用iTOL，evolview等2款在線繪圖平臺，然...
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左手python右手R
寫在前面 最近在學(xué)習(xí)python，結(jié)合一個(gè)實(shí)際案例，寫一下python和R在做數(shù)據(jù)分析上的差異。本人還不是特別熟練python，所以python的代碼來自于kagle的一個(gè)高...
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limma、DESeq2、edgeR差異分析及繪制韋恩圖不同的時(shí)空以及不同的條件下差異基因分析是RNAseq分析的重要目標(biāo)。差異表達(dá)分析方法包括：基于Read數(shù)目：DESeq、limma和edgeR；基于組裝技術(shù)：Cuffdif和...
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差異分析的檢驗(yàn)方法前言 眾所周知，當(dāng)你所自己今年比去年更優(yōu)秀的時(shí)候是不可以隨便吹牛的，請把你在簡書上發(fā)文的頻率以及質(zhì)量擺出來！ 面對今年和去年的數(shù)據(jù)，或許你需要一個(gè)統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)的方法... 組間差...
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R包：dplyr包數(shù)據(jù)塑形利器介紹 更多知識分享請到 https://zouhua.top/[https://zouhua.top/]。dplyr是data manipulation的包，其包含多個(gè)處理數(shù)...
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生信技能樹，RNA-seq新開了jimmy老師開的服務(wù)器，下載數(shù)據(jù)還是跑流程，感覺飛起來了一下，感激萬分。 言歸正傳：下面是新的流程： 文章：兩篇： ①、Cancers | Free Full-Tex...
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數(shù)據(jù)分析：RT-qPCR分析介紹 做完轉(zhuǎn)錄組分析之后，一般都要求做qRT-PCR來驗(yàn)證二代測序得到的轉(zhuǎn)錄本表達(dá)是否可靠。熒光定量PCR是一種相對表達(dá)定量的方法，他的計(jì)算方法有很多，常用的相對定量數(shù)據(jù)分析...
