DESeq2在R-studio上的安裝非常讓人自閉，具體可參考徐洲更老師的R語言安裝介紹https://www.bilibili.com/video/BV19p4y1i7Zb...
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DESeq2安裝避坑
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— circlize 基因組高級繪圖軌跡函數(shù) 1. Ideograms 在前面的例子中，我們使用 circos.initializeWithIdeogram() 函數(shù)來初始化圓形繪圖并添加染色體圖形（ideog...
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ggplot2繪制獨特的分面圖本節(jié)來介紹如何使用ggplot2自定義繪制分面并添加統(tǒng)計信息,以及單分面數(shù)據(jù)注釋 加載R包 繪制并排箱線圖 通常geom_boxplot函數(shù)繪制的箱線圖都是不帶誤差線的，在此...
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樹莓派綜合項目3：AI視覺機(jī)械臂小車（四）紅外避障一、介紹 ??樹莓派綜合項目3：AI視覺機(jī)械臂小車（一）蜂鳴器[http://www.itdecent.cn/p/58aebf35a315]??樹莓派綜合項目3：AI視覺機(jī)...
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— ggplot 統(tǒng)計圖層前言 雖然我們介紹了這么多節(jié)的 ggplot2，我們在繪制圖層時基本上使用的都是 geom_*() 函數(shù)，卻很少使用 stat_*() 函數(shù)。 當(dāng)然，使用 geom_*() ...
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基因家族分析(2) ggplot2繪制motif分析圖隔了這么長時間終于開始更新基因家族的第2篇文檔了，繪制motif分析圖。以往做這類分析都是通過TBtools此款軟件，今天讓我們通過ggplot2來繪制一個更加富有美感的mo...
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基因家族分析(4)ggtree繪制高端進(jìn)化樹系統(tǒng)發(fā)育樹幾乎是基因家族文章的必備圖，一個好看的樹圖的確能給文章增色不少，一般的用戶可能只使用MEGA繪圖，進(jìn)階一點的便會使用iTOL，evolview等2款在線繪圖平臺，然...
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左手python右手R
寫在前面 最近在學(xué)習(xí)python，結(jié)合一個實際案例，寫一下python和R在做數(shù)據(jù)分析上的差異。本人還不是特別熟練python，所以python的代碼來自于kagle的一個高...
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limma、DESeq2、edgeR差異分析及繪制韋恩圖不同的時空以及不同的條件下差異基因分析是RNAseq分析的重要目標(biāo)。差異表達(dá)分析方法包括：基于Read數(shù)目：DESeq、limma和edgeR；基于組裝技術(shù)：Cuffdif和...
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R包：dplyr包數(shù)據(jù)塑形利器介紹 更多知識分享請到 https://zouhua.top/[https://zouhua.top/]。dplyr是data manipulation的包，其包含多個處理數(shù)...
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生信技能樹，RNA-seq新開了jimmy老師開的服務(wù)器，下載數(shù)據(jù)還是跑流程，感覺飛起來了一下，感激萬分。 言歸正傳：下面是新的流程： 文章：兩篇： ①、Cancers | Free Full-Tex...
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數(shù)據(jù)分析：RT-qPCR分析介紹 做完轉(zhuǎn)錄組分析之后，一般都要求做qRT-PCR來驗證二代測序得到的轉(zhuǎn)錄本表達(dá)是否可靠。熒光定量PCR是一種相對表達(dá)定量的方法，他的計算方法有很多，常用的相對定量數(shù)據(jù)分析...
