1. 報錯 ??上面的報錯信息都是引用的網(wǎng)絡(luò)，自己的報錯信息，等到解決后，沒有了。 2. 原因 ??是vscode官方升級導(dǎo)致對之前的glibc的一些庫不支持了： 3. 解決...
IP屬地：北京
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vscode遠程連接突然出現(xiàn)報錯顯示glibc問題 -
NormqPCR筆記對應(yīng)文獻之一
title: NormqPCR筆記對應(yīng)文獻之一date: 2019-10-01 12:00:00type: "tags"tags: miRNA qPCR 內(nèi)參categori...
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NormqPCR包筆記
前言 NormqPcR這個包用于對qPCR數(shù)據(jù)進行均一化(normalization，這里需要注意的是，這里的normalization只是使用內(nèi)參來校正目標(biāo)基因的表達的意思...
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@yangshichen 這個是沒問題，只要符合輸入格式
BSgenome 構(gòu)建自己的參考基因組
1. 目的 ??最近在某個分析的時候，需要BSgenome object，然而我的物種不是常見的物種，是自己組裝出來的多倍體物種，因此沒法用已有的BSgenome參考基因組，...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析—PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建在得到我們感興趣的基因集后，除了對其進行GO等富集分析查看與什么重要的生物學(xué)通路相關(guān)，還可以進行PPI蛋白互作網(wǎng)絡(luò)（PPI, Protein-Protein Interact...
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結(jié)構(gòu)方程模型(SEM)可用于微生態(tài)研究及R語言實現(xiàn)導(dǎo)讀 結(jié)構(gòu)方程模型（Structural Equation Modeling，SEM）是一種能基于變量之間的協(xié)方差矩陣分析多變量之間結(jié)構(gòu)關(guān)系的多元統(tǒng)計分析方法，也被稱為協(xié)方差...
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【機器學(xué)習(xí)】xgboost使用技巧sklearn api與原生api python下的xgboost有兩套api，一套是原生api，一套是sklearn風(fēng)格的api。兩套api的邏輯還是區(qū)別較大的，但是考慮到...
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ATAC-seq生信分析綜述翻譯(Genome Biology)這是目前為止我看到過的關(guān)于ATAC-seq的最新綜述，感興趣的話值得一讀。2020.4.22更新：我看到一個公眾號也翻譯了這篇文章，而且正好跟我這篇翻譯是在同一天發(fā)表http...
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生信分析7：如何利用ATAC-seq數(shù)據(jù)鑒定轉(zhuǎn)錄因子活性前一篇推送解讀了2022年發(fā)表在DC上的關(guān)于擬南芥再生的文章。文章種利用TOBIAS鑒定了轉(zhuǎn)錄因子的活性。本次推送將介紹這款軟件的原理及使用。 TOBIAS——2020NC ...
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DecontX - 去除單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中環(huán)境RNA污染
DecontX是一種通過去除RNA測序數(shù)據(jù)中非細胞信號的工具，它適用于單細胞RNA測序數(shù)據(jù)和高通量RNA測序數(shù)據(jù)。https://github.com/campbio/cel...
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抗體編號系統(tǒng)抗體工程技術(shù)在藥物開發(fā)中具有越來越重要的意義，并且已經(jīng)開發(fā)了不同的生物治療劑，包括利用抗體片段，雙特異性抗體或抗體—藥物偶聯(lián)物。 然而，盡管它們在藥物治療中取得了越來越大的成...
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Matrix::readMM包報Dim_validate錯誤
Matrix::readMM包報Dim_validate錯誤 在使用Matrix::readMM讀取10x的mtx文件的時候，出現(xiàn)一下報錯： 在google上搜索各種問題，沒...
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monocle2 exprs報錯
1. 發(fā)現(xiàn)報錯 在進行monocle2發(fā)育軌跡的時候，從來么有報錯的軟件，竟然罷工了，出現(xiàn)了如下報錯： 檢查報錯： 這說明不是monocle2對象的問題，可能是函數(shù)的問題？ ...
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好好學(xué)習(xí) 天天向上
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是的，之前的版本是沒有這個功能。
10xGenomics單細胞轉(zhuǎn)錄組--細胞核mRNA分析
需求 ??由于某些特定的環(huán)境，可能老師能夠得到完整的細胞核，得不到完整的細胞，但是又想研究其細胞的單細胞轉(zhuǎn)錄組，就只能用細胞核進行10xGenomics單細胞轉(zhuǎn)錄組分析；或者...
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rdkit可視化原子序號
rdkit中對于單個原子的操作，常常是通過GetAtomWithIdx這個函數(shù)來實現(xiàn)的，然后可以對該原子做各種下游操作，但對于本身沒有明確序號的原子，人難以確認該輸入哪個序號...
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將化合物分子數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化（移除電荷、小片段、互變異構(gòu)、空間信息）在AI應(yīng)用的數(shù)據(jù)準(zhǔn)備階段，或者化合物數(shù)據(jù)庫歸類合并時，會有將同個化合物的不同形式標(biāo)準(zhǔn)化的需求。這樣在比對時，就可以通過標(biāo)準(zhǔn)化后的SMILES的字符串比對，方便地處理化合物數(shù)據(jù)...
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@c8578639f23c 這種報錯沒有遇到過，我也會經(jīng)常遇到未知的報錯，你先檢查一下文件的輸入是否有問題。或者官方GitHub上面查一下
單細胞轉(zhuǎn)錄組||matrix.mtx說明（cellranger與kallistobustools的不同之處）
1. matrix.mtx ??做過10xGenomics單細胞轉(zhuǎn)錄組的人都知道cellranger的標(biāo)準(zhǔn)輸出是三個文件（barcodes.tsv genes.tsv m...
