定義 系統(tǒng)發(fā)育進化樹 (Phylogenetic tree)： 一般也叫系統(tǒng)進化樹，進化樹。它可以利用樹狀分支圖形來表示各物種或基因間的親緣關(guān)系。一般研究對象是堿基序列或氨基...
發(fā)簡信
IP屬地：重慶
-
系統(tǒng) 發(fā)育樹 -
請問Y軸是表型數(shù)據(jù)嗎？怎么得到不同個體的某個位點的基因型呢？
2024-03-29基因型分布畫出箱線圖標(biāo)注顯著性
GWAS分析后，顯著性的SNP，我們想把不同的分型在群體里面的表型進行可視化，現(xiàn)在最流行的方法是箱線圖+散點圖+顯著性標(biāo)識，類似的圖片如下： 上面A、B、C是三種基因型，比如...
-
QTL定位方法及花期文章閱讀記錄11摘要部分 起初，大芻草進化而來的玉米是短日照，在短日條件下開花，長日照條件下花期推遲甚至不開花。通過定位克隆和關(guān)聯(lián)定位，將一個花期數(shù)量性狀位點確定位于CCT轉(zhuǎn)錄因子(ZmC...
-
請問這個問題你解決了嗎？
在stringtie結(jié)果中提取count/fpkm/tpm matrix
stringtie官網(wǎng)[http://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.shtml?t=manual]提供了prepDE.py文件，用...
-
有參轉(zhuǎn)錄組的比對
一、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 1、測序數(shù)據(jù) （1 ）公司獲得（2） NCBI下載/ENA下載 2、參考序列準(zhǔn)備 （1）基因組序列 下載地址：Ensembl、EnsemblGenomes、NC...
-
玉米花粉發(fā)育相關(guān)過程
參考學(xué)習(xí)自公眾號：細(xì)胞全能型與再生 玉米雄穗每個分支上有多個小花，每朵小花又包含一朵較大的上位花和一朵較小的下位花。通常上位花比下位花在發(fā)育進程上早一天。每朵上/下位花分別含...
-
繪制 SNP 密度圖一般使用 CMplot 繪制SNP密度圖：包鏈接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要繪制 SNP 密度圖，僅僅需要三列即可：a. 第...
-
GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析全流程
拖拖拉拉用了一年時間才把GWAS整個流程捋完，從背景到code、還有過程中遇到的一些bug以及解決辦法，加起來也有二十余篇，按分析的流程整理出一份清單，也許以后有新的方法或者...
-
個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
-
PGDspider的使用1、該軟件的使用需要在java環(huán)境內(nèi)，下載java并安裝 https://download.oracle.com/java/18/latest/jdk-18_windows-...
-
加油少年
-
