SingleR 教程網(wǎng)址（https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/SingleR/inst/...
發(fā)簡信
IP屬地：甘肅
-
【單細胞】SingleR注釋細胞類型
-
技術(shù) | 單細胞轉(zhuǎn)錄組測序之Smart-seq2Smart-seq2 Smart-seq是由路德維格癌癥研究所的 Rickard Sandberg實驗室[http://sandberg.cmb.ki.se/]所開發(fā)的一套在...
-
單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析||Seurat3.1教程:Interoperability between single-cell object formats本節(jié)，我們演示了在Seurat對象、singlecellexper對象和anndata對象之間進行轉(zhuǎn)換的能力。以建立Seurat與其他單細胞數(shù)據(jù)分析工具之間的鏈接。 Seur...
-
scanpy分析單細胞數(shù)據(jù)R在讀取和處理數(shù)據(jù)的過程中會將所有的變量和占用都儲存在RAM當中，這樣一來，對于海量的單細胞RNA-seq數(shù)據(jù)（尤其是超過250k的細胞量），即使在服務(wù)器當中運行，Seura...
-
可以用awk將剩下三列信息手動添加上去，第四列是基因名字，可以自己先任意命名，或者參照基因組注釋。第五列就用“.”代替就行。第六列表示正負鏈信息，不重要的話就都標成“+”吧。參照命令：awk -v OFS="\t" '{print $1, $2, $3, "Gene", ".", "+" }' your.col3.bed > new.col6.bed
【生信】格式轉(zhuǎn)換：轉(zhuǎn)成bed及bed12格式
基因組注釋gtf文件或bed6文件轉(zhuǎn)bed12文件 上一篇詳細介紹了bed格式，尤其清楚的解釋了bed格式中的最后三列，這三列對于理解bed12格式轉(zhuǎn)換至關(guān)重要。 本文主要介...
-
教你用科學(xué)雜志喜歡的配色作圖——R包ggsci
ggsci是ggplot的主題包，它提供一系列高質(zhì)量的調(diào)色板，其靈感來自于科學(xué)期刊、數(shù)據(jù)可視化庫、科幻電影和電視節(jié)目中使用的顏色。ggsci中的調(diào)色板可以作為ggplot2s...
-
2019-06-09
R的安裝還是很簡單的，在cran上找到下載連接,然后下載安裝包就好了。同樣，安裝后續(xù)的Rstudio也是如此。將兩個軟件都安裝好后，試著在Rstudio里安裝第三方的Libr...
-
單細胞轉(zhuǎn)錄組||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial同系列文章： sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[http://www.itdecent.cn/p...
-
Linux下的并行神器——parallel
GNU Parallel是一個shell工具，為了在一臺或多臺計算機上并行的執(zhí)行計算任務(wù)。本文簡要介紹GNU Parallel的使用。 1、parallel 用法簡介 1.1...
-
PPT VBA 的學(xué)習(xí)筆記
PPT VBA 與 Excel VBA 的對比 掌握 VBA 并不是一門業(yè)余愛好，而是一種工作能力，才成為職業(yè)安全的保障。同時，現(xiàn)代企業(yè)業(yè)務(wù)對 VBA 的解決方案需求巨大， ...
-
endnote 第100行縮進變寬解決辦法檢查畢業(yè)論文時，發(fā)現(xiàn)一個問題，endnote加入的參考文獻：第100個參考文獻，編號和參引文字之間距離變寬，如下： 百度了一下，沒有找個合適的方法，于是自己研究了一下Endn...
-
R使用筆記: ggplot2做boxplot的幾個細節(jié)本次筆記內(nèi)容：fill =的位置： ggplot(aes(fill = )) & geom_boxplot(fill = ) & geom_boxplot(aes(fill ...
