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    擴(kuò)增子分析:qiime2平臺(tái)全流程分析

    Amplicon sequencing analysis pipeline through qiime2 platform qiime2是擴(kuò)增子數(shù)據(jù)分析的最佳平臺(tái)之一,其提供...

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    「基因組」JupiterPlot評(píng)估基因組

    1.JupiterPlot下載地址:https://github.com/JustinChu/JupiterPlot[https://github.com/JustinChu...

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    宏基因組組裝工具如何選擇?MetaSPAdes還是Megahit?

    導(dǎo)讀 宏基因組組裝工具非常多。如何從眾多組裝工具中選擇適合組裝自己的宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)的工具呢?為了解決這個(gè)問(wèn)題,我搜集了一些近些年已發(fā)表的宏基因組組裝工具,并且利用已發(fā)表文章...

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    GO富集分析

    數(shù)據(jù)來(lái)源表達(dá)量差異分析的表格,需要log2(foldchange),Pvalue,FDR 上下調(diào)基因篩選,上調(diào)基因篩選條件log2(foldchange)>=1,Pvalue...

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    RNA-SEQ(七):TBtools做GO富集分析及R中的可視化

    題目:對(duì)DEseq2差異分析得到的差異基因進(jìn)行GO富集。 目的:旨在對(duì)基因和蛋白質(zhì)功能進(jìn)行限定和描述的。 內(nèi)容:1. 下載GO注釋背景文件,準(zhǔn)備好需要富集的基因列表。 2. ...

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    bed基因注釋

    日常瞎掰 ??工欲善其事必先利其器,好用的工具對(duì)做事來(lái)說(shuō)很重要,可以讓你做起事來(lái)收到事半功倍的效果。前段時(shí)間分析數(shù)據(jù)時(shí),需要給intervals做基因注釋?zhuān)枰僮鱣tf文件...

  • Markdown 基礎(chǔ)操作

    Markdown 是什么? Markdown 是一種輕量級(jí)標(biāo)記語(yǔ)言,它允許人們使用易讀易寫(xiě)的純文本格式編寫(xiě)文檔。 為什么用Markdown ? 純文本,所以兼容性極強(qiáng),可以用...

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    雙曲線火山圖一鍵拿捏

    日常瞎掰 ??火山圖作為展示差異基因的首選,可以說(shuō)是生信分析常見(jiàn)的圖形了。常規(guī)的火山圖會(huì)在x、y軸方向上添加垂直參考線,以方便區(qū)分滿(mǎn)足閾值的差異基因。常規(guī)的火山圖這里就不多了...

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    強(qiáng)到離譜!2023年必備的21款A(yù)I工具

    2022年是AI技術(shù)大發(fā)展的一年,特別是ChatGPT的很空出世,讓AI工具迎來(lái)大爆發(fā),今天就給大家整理出21款免費(fèi)且實(shí)用的AI工具推薦,無(wú)論是做設(shè)計(jì)還是日常學(xué)習(xí)工作都能用得...

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    模式植物GO功能富集分析,背景基因制作教程

    前言 我們?cè)谧鲛D(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析時(shí),大多數(shù)都會(huì)進(jìn)行功能富集分析,預(yù)測(cè)目的基因所具有的的功能。富集工具常用到的R語(yǔ)言中clusterProfiler包,里面包含了上千個(gè)功能富集的背...

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