Amplicon sequencing analysis pipeline through qiime2 platform qiime2是擴增子數(shù)據(jù)分析的最佳平臺之一,其提供...
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1.JupiterPlot下載地址:https://github.com/JustinChu/JupiterPlot[https://github.com/JustinChu...
導(dǎo)讀 宏基因組組裝工具非常多。如何從眾多組裝工具中選擇適合組裝自己的宏基因組測序數(shù)據(jù)的工具呢?為了解決這個問題,我搜集了一些近些年已發(fā)表的宏基因組組裝工具,并且利用已發(fā)表文章...
數(shù)據(jù)來源表達量差異分析的表格,需要log2(foldchange),Pvalue,FDR 上下調(diào)基因篩選,上調(diào)基因篩選條件log2(foldchange)>=1,Pvalue...
題目:對DEseq2差異分析得到的差異基因進行GO富集。 目的:旨在對基因和蛋白質(zhì)功能進行限定和描述的。 內(nèi)容:1. 下載GO注釋背景文件,準備好需要富集的基因列表。 2. ...
日常瞎掰 ??工欲善其事必先利其器,好用的工具對做事來說很重要,可以讓你做起事來收到事半功倍的效果。前段時間分析數(shù)據(jù)時,需要給intervals做基因注釋,需要操作gtf文件...
Markdown 是什么? Markdown 是一種輕量級標記語言,它允許人們使用易讀易寫的純文本格式編寫文檔。 為什么用Markdown ? 純文本,所以兼容性極強,可以用...
日常瞎掰 ??火山圖作為展示差異基因的首選,可以說是生信分析常見的圖形了。常規(guī)的火山圖會在x、y軸方向上添加垂直參考線,以方便區(qū)分滿足閾值的差異基因。常規(guī)的火山圖這里就不多了...
2022年是AI技術(shù)大發(fā)展的一年,特別是ChatGPT的很空出世,讓AI工具迎來大爆發(fā),今天就給大家整理出21款免費且實用的AI工具推薦,無論是做設(shè)計還是日常學習工作都能用得...
前言 我們在做轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析時,大多數(shù)都會進行功能富集分析,預(yù)測目的基因所具有的的功能。富集工具常用到的R語言中clusterProfiler包,里面包含了上千個功能富集的背...