targetScan 基于文獻《Prediction of Mammalian MicroRNA Target 》中的敘述,往往通過miRNA的 seed region(5‘...
targetScan 基于文獻《Prediction of Mammalian MicroRNA Target 》中的敘述,往往通過miRNA的 seed region(5‘...
一、前言 最近臨近畢業(yè),寫畢業(yè)論文需要從知網(wǎng)查找大量的文獻。但去知網(wǎng)一條一條進去看摘要又略顯麻煩和浪費時間。于是,反手寫一個爬蟲,批量獲取基本信息,豈不美哉?在開始這個項目之...
基本概念 表達趨勢分析(Series Test of Cluster):將變化特征模式相似的基因歸類到一種變化趨勢中,從而找到實驗變化過程中最具有代表性的基因集以及對應的趨勢...
我們在做基因組或者轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的時候,經(jīng)常需要用到染色體的長度。今天我們就來聊聊如何獲取染色體的長度。我們以人的為例,給大家介紹兩種不同的方法,都要用到著名的公共數(shù)據(jù)庫UC...
| Database | URL | Species || RARTF | http://rarge.gsc.riken.jp/rartf/ | 擬南芥 || AGRIS, ...
前言 pathview是一個通路可視化友好的R包,最主要的是它支持多組學數(shù)據(jù)映射(基因/蛋白-代謝)。自己用過它的R包,后來發(fā)現(xiàn)有網(wǎng)頁版的,果斷介紹給學員。因為不常用,記錄要...
Enrichment Map是一個用于功能豐富可視化Cytoscape軟件的插件,必須使用任何可用方法在EnrichmentMap之外生成富集結(jié)果。將基因集(例如通路和Gen...
“做cox比例分析和KM曲線結(jié)合分析,閾值該怎么選取,數(shù)據(jù)是否需要標準化等等問題的解決方法” 01—研究背景 對基因功能富集結(jié)果的展示有很多種展示方法,有人說氣泡圖展示富集結(jié)...
作為一個生物學家(zha),差異表達分析似乎是一項必備的技能。然鵝對于一個沒有任何編程基礎的生物學家,寫代碼是那么神秘莫測而又遙不可及,讓人腦殼疼。那么今天小編就為大家介紹一...