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240 發(fā)簡信
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  • 構(gòu)建強(qiáng)大女性黃金法則-1

    之前我問了有多少女生對(duì)變美這件事感興趣,點(diǎn)贊留言的人很多,但是更多都是男性。我不知道到底有多少女性對(duì)這件事感興趣,或者愿意相信我,但是我認(rèn)為我需要持續(xù)做正確的事情,真正去幫助...

  • @huang_7 已經(jīng)發(fā)表了,這篇文章有些多序列結(jié)果分析的流程啊。如果是多序列比對(duì),是MUSCLE吧,結(jié)果分析這篇文章有提及。

    用PLAM下的mcmctree做分歧時(shí)間估計(jì)

    用mcmctree做分歧時(shí)間估計(jì)的時(shí)候遇到報(bào)錯(cuò): 問題是序列不符合phylip格式,每個(gè)名字沒有區(qū)分開 1.使用以下命令行將orthofinder處理好的多序列比對(duì)結(jié)果,fa...

  • @Yorleleiyo 不正常吧,用conda吧‘conda install -c bioconda cafe’

    用CAFE做基因家族收縮擴(kuò)張

    以下基于cafe 5版本cafe5以前的版本,都需要寫cafe.script,更麻煩,推薦版本5.常用的cafe參數(shù)為 input文件使用之前做的orthofinder得到的...

  • 2022年和三年計(jì)劃

    越是長大以后越是發(fā)現(xiàn),所有的計(jì)劃和目標(biāo),需要用至少三年的時(shí)間澆灌 總結(jié)我所存在的問題: 基本功方法和語言領(lǐng)域知識(shí)統(tǒng)計(jì)腳本語言腫瘤和醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)數(shù)學(xué)python和RML基礎(chǔ) 以上用...

  • research proposal研究計(jì)劃撰寫的保姆級(jí)教程

    申請(qǐng)PhD這段時(shí)間,光proposal就寫了4份,而且1-2和3-4還是不同方向。第一份研究計(jì)劃也是抓耳撓腮寫了兩個(gè)周還多,被老師點(diǎn)贊說“nice”。第三份研究計(jì)劃因?yàn)橐臅r(shí)...

  • @聰明小崽子 linux安裝一般包括軟件源安裝比如conda,源代碼編譯。你說的git安裝,我理解的是github下載軟件,里面有多種安裝方式。cafe5的官網(wǎng)document有很多安裝的信息,只要你安裝好了,不存在所謂的linux還是git,一個(gè)東西。

    用CAFE做基因家族收縮擴(kuò)張

    以下基于cafe 5版本cafe5以前的版本,都需要寫cafe.script,更麻煩,推薦版本5.常用的cafe參數(shù)為 input文件使用之前做的orthofinder得到的...

  • 你好,把這段代碼的FALSE改為TRUE就可以了

    關(guān)閉Chrome左右滑動(dòng)時(shí)返回上一個(gè)網(wǎng)頁

    我用Mac電腦上用Chrome時(shí),有一點(diǎn)非常不便讓我常常無語。也不知道哪個(gè)工程師開發(fā)的功能,這么扯,每次用觸摸板滑動(dòng)瀏覽網(wǎng)頁的時(shí)候,它會(huì)自動(dòng)抓取你左滑動(dòng)或者右滑動(dòng),變?yōu)榉祷厣?..

  • 2022年第二季度計(jì)劃

    第一個(gè)季度完成情況 上個(gè)季度的計(jì)劃寫的時(shí)候內(nèi)容就很多,那時(shí)候又想補(bǔ)短板,把R語言進(jìn)階到寫包水平,又剛好加入DAIR團(tuán)隊(duì)實(shí)習(xí),有大量的深度學(xué)習(xí)工作要做。沒想到自己能夠基本完成,...

  • 擬題有感

    從我個(gè)人經(jīng)歷來講,生物出身做生信是一件比較受歧視的事情,人們往往更重視那些學(xué)計(jì)算機(jī)的朋友。但是看的文獻(xiàn)越多我越想表達(dá),生物問題的把握上,需要我們這樣學(xué)生物的人參與,因?yàn)閮烧叩?..

  • 120
    我的生信之路

    2022-2-7 凌晨 我很喜歡思考問題,所以有時(shí)候顯得想的很多。我的生信學(xué)習(xí)一路走來,我積攢了數(shù)篇學(xué)習(xí)筆記、學(xué)習(xí)計(jì)劃和學(xué)習(xí)總結(jié),臨到最近,我想不起來學(xué)習(xí)過程中許多的細(xì)節(jié),頭...

  • @貪星的蘑菇 你能不能把你的mcmctree結(jié)果發(fā)給我看一下,因?yàn)閛rthofinder的結(jié)果有有很多,因?yàn)檫@個(gè)分析我做的時(shí)間很久了有點(diǎn)忘記了細(xì)節(jié),不過我記得orthofinder是不做多序列比對(duì)的,多序列比對(duì)一般用MUSCLE,orthofinder是聚類的。你最好給我看看你的報(bào)錯(cuò)

    用PLAM下的mcmctree做分歧時(shí)間估計(jì)

    用mcmctree做分歧時(shí)間估計(jì)的時(shí)候遇到報(bào)錯(cuò): 問題是序列不符合phylip格式,每個(gè)名字沒有區(qū)分開 1.使用以下命令行將orthofinder處理好的多序列比對(duì)結(jié)果,fa...

  • 離開的優(yōu)先準(zhǔn)備

    團(tuán)團(tuán) 為了把團(tuán)團(tuán)帶回山東,我們費(fèi)了許多功夫。為了檢驗(yàn)檢疫證書,我跑了三趟檢驗(yàn)檢疫局。邁著前一天剛練完的腿爬上爬下時(shí),我想我們對(duì)團(tuán)團(tuán)也是盡心盡力負(fù)責(zé)了。多次打電話等位咨詢航空公...

  • 2022年第一季度計(jì)劃

    GCN實(shí)習(xí) 找了一份北大計(jì)算機(jī)學(xué)院的實(shí)習(xí)工作,老師的方向圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),我的目標(biāo)是做GCN應(yīng)用于生物領(lǐng)域。目標(biāo)發(fā)表一篇文章,不要求點(diǎn)數(shù)高,只求口碑好。 R工具包 最近在給R打...

  • 2021年總結(jié)

    剛寫完一個(gè)研究計(jì)劃,這個(gè)研究計(jì)劃收集閱讀整理文獻(xiàn)花了2天,找idea, research gap和寫作花了2天,一共四天。昨晚上寫完的時(shí)候,整個(gè)人已經(jīng)漿糊了,深深地感受到了什...

  • @NEWwitch 你這個(gè)是ctl_tree.ctl里面有東西寫錯(cuò)了,你看看你是不是參數(shù)(例如-a)寫了沒有具體的數(shù)值。還有一種可能性是你重復(fù)寫參數(shù)了。建議你檢查一下你的ctl_tree.ctl,先看是不是打錯(cuò)字和標(biāo)點(diǎn)了,再看是否有重復(fù)的參數(shù)。

    用PLAM下的mcmctree做分歧時(shí)間估計(jì)

    用mcmctree做分歧時(shí)間估計(jì)的時(shí)候遇到報(bào)錯(cuò): 問題是序列不符合phylip格式,每個(gè)名字沒有區(qū)分開 1.使用以下命令行將orthofinder處理好的多序列比對(duì)結(jié)果,fa...

  • 如何寫個(gè)生信軟件之百家談

    劍鋒 上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院、醫(yī)學(xué)基因組學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在讀研究生(2015年入學(xué))主要感興趣的研究方向:數(shù)據(jù)可視化;高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析方法開發(fā);臨床檢測(cè)相關(guān)的軟件和...

  • 關(guān)閉Chrome左右滑動(dòng)時(shí)返回上一個(gè)網(wǎng)頁

    我用Mac電腦上用Chrome時(shí),有一點(diǎn)非常不便讓我常常無語。也不知道哪個(gè)工程師開發(fā)的功能,這么扯,每次用觸摸板滑動(dòng)瀏覽網(wǎng)頁的時(shí)候,它會(huì)自動(dòng)抓取你左滑動(dòng)或者右滑動(dòng),變?yōu)榉祷厣?..

  • @奶咖真好喝 利用Aa和核苷酸,其實(shí)是一樣的,就是參數(shù)記得寫成AA就行了。,但是我做的時(shí)候直接用的model=0,我認(rèn)為模型不是最重要的。如果你一直報(bào)錯(cuò),我認(rèn)為應(yīng)該是數(shù)據(jù)格式的問題。

    用PLAM下的mcmctree做分歧時(shí)間估計(jì)

    用mcmctree做分歧時(shí)間估計(jì)的時(shí)候遇到報(bào)錯(cuò): 問題是序列不符合phylip格式,每個(gè)名字沒有區(qū)分開 1.使用以下命令行將orthofinder處理好的多序列比對(duì)結(jié)果,fa...

個(gè)人介紹
腫瘤基因組學(xué)、計(jì)算結(jié)構(gòu)生物學(xué),2019年6月入門至今。
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