老師你好，請(qǐng)問一下，在這行代碼中--mycds <- estimateDispersions(mycds, cores=1, relative_expr = TRUE)--,relative_expr=TRUE是使用相對(duì)表達(dá)量來估計(jì)離散度；我想問一下，這個(gè)的目的是什么，相對(duì)于沒有這個(gè)參數(shù)，有什么更好的分析效果
2021-05-16 scRNA基礎(chǔ)分析：偽時(shí)間分析主要通過MonocleR包，使用反向圖形嵌入(Reversed Graph Embedding)的機(jī)器學(xué)習(xí)算法，來學(xué)習(xí)描述細(xì)胞如何從一種狀態(tài)過渡到另外一種狀態(tài)的軌跡。其中分析...
分開與合在一起都可以分析，但目的不同。 分開分析更多強(qiáng)調(diào)看通路是被激活還是被抑制； 合在一起分析更宏觀。 1 為什么要分開討論？因?yàn)槲覀兿Ｍㄟ^看顯著上調(diào)或下調(diào)的基因中通過G...
年底復(fù)盤，發(fā)現(xiàn)很多知識(shí)點(diǎn)理解并不深入，想對(duì)這些不清晰的知識(shí)點(diǎn)重新梳理一下。 一、NormalizeData()歸一化 考慮到文庫測序深度的影響，我們需要對(duì)單細(xì)胞counts矩...
NMF算法簡介 非負(fù)矩陣分解(Non-negative Matrix Factorization, NMF)的思想可以描述為，對(duì)于任意給定的一個(gè)非負(fù)矩陣V，NMF算法能夠找到...
在R語言中，set.seed函數(shù)是一個(gè)重要的工具，它用于設(shè)置隨機(jī)數(shù)生成器的種子。種子是隨機(jī)數(shù)生成過程中的起始點(diǎn)，它決定了隨機(jī)數(shù)序列的起始值。通過設(shè)置相同的種子，我們可以確保每...
醫(yī)學(xué)生零基礎(chǔ)學(xué)生信是先學(xué)Python還是先學(xué)R語言？[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何學(xué)習(xí)R語言[https://www...
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