Rstudio server卡死Rstudio Server長時間加載不出來,重啟無效原因: 緩存過大無法成功加載解決辦法:刪除session中的active 文件。路徑：~...
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Rstudio卡死難以進入問題
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單細(xì)胞之富集分析-6：PROGENy單細(xì)胞富集分析系列： 單細(xì)胞之富集分析-1：單細(xì)胞GSEA分析流程[http://www.itdecent.cn/p/00f069cb239c] 單細(xì)胞之富集分析-2：批量...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）通訊分析之總結(jié)Nichenet生態(tài)位通訊比較分析作者，追風(fēng)少年i 系統(tǒng)總結(jié)nichenet多條件通訊差異分析 nichenet的原理大家可以參考文章10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）通訊分析之NicheNet[http://...
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NicheNet ||細(xì)胞間相互作用分析NicheNet（https://github.com/saeyslab/nichenetr[https://github.com/saeyslab/nichenetr]）是...
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空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之生態(tài)位聚類（Banksy）作者，Evil Genius hello，好久不見，最近一直在忙空間轉(zhuǎn)錄組培訓(xùn)班的事情，簡書更新較少，大家感興趣可以去B站看看上課的視頻，希望對大家有所幫助。 今天我們需要分...
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cellphoneDB嘔心瀝血下載安裝教程
我安裝了一天之后快哭了，然后去100塊買了個老師指導(dǎo)生信自學(xué)要么哭要么花錢，就是我這個垃圾1、安裝https://github.com/ventolab/CellphoneD...
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illumina beadchip 芯片原始數(shù)據(jù)處理需求 和這一篇的需求一致，不同公司的芯片原始數(shù)據(jù)處理方式也不同，最終都是為了得到表達矩陣，今天介紹的是illumina beadchip 芯片，用神奇的limma搞定它。找不...
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如何實現(xiàn)GSEA-基因富集分析？基因富集分析（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA）是一種針對全基因組表達譜芯片數(shù)據(jù)的分析方法，將基因與預(yù)定義的基因集進行比較。即綜合現(xiàn)有的對基...
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Cytoscape繪制相關(guān)網(wǎng)絡(luò)圖導(dǎo)讀 用R軟件corr.test函數(shù)進行兩組數(shù)組的相關(guān)性分析，用Cytoscape繪制相關(guān)網(wǎng)絡(luò)圖。 一、輸入數(shù)據(jù) 代謝數(shù)據(jù)：metabo.txt 16S數(shù)據(jù)：genus.tx...
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TCGA文章復(fù)現(xiàn)——LncRNA-CRC預(yù)后Title:An Integrated Three-Long Non-coding RNA Signature Predicts Prognosis in Colorecta...
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Linux安裝R包TwoSampleMR遇見的報錯
最近一位老友在倒騰GWAS的研究，發(fā)現(xiàn)R包TwoSampleMR用于pQTL的分析，讓我在Linux系統(tǒng)上幫忙安裝下，根據(jù)網(wǎng)頁的安裝提示進行操作（https://g...
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#circRNA從入門到精通#circRNA從入門到精通[https://mp.weixin.qq.com/mp/appmsgalbum?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&action=ge...
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SNP數(shù)據(jù)構(gòu)建系統(tǒng)進化樹大概是長期的不鍛煉使得今天的爬山運動過量了，接著悲劇就是無法入眠。也幸虧明天是周日，干脆就起床碼字了?？偨Y(jié)下自己前面用snp構(gòu)建系統(tǒng)進化樹的方法吧。 1.構(gòu)建進化樹的算法 構(gòu)...
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snp數(shù)據(jù)構(gòu)建NJtree（phylip軟件）參考鏈接 SNP數(shù)據(jù)構(gòu)建系統(tǒng)進化樹 - 簡書[http://www.itdecent.cn/p/57599b6a71e8]http://www.itdecent.cn/p...
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miRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預(yù)測新miRNA，到表達矩陣【一】該教程分為2部分，第2部分在：miRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預(yù)測新miRNA，到表達矩陣【二】 因為之前碰到...
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方便快捷的smallRNA數(shù)據(jù)分析流程前言 ??今天來跟大家分享一個smallRNA的分析流程——sRNAnalyzer[http://srnanalyzer.systemsbiology.net/]。這個流程是...
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ggplot2之顏色設(shè)置
該文章為個人為了復(fù)習(xí)總結(jié)的筆記，參考來源為： https://www.sohu.com/a/348752646_785442 http://www.itdecent.cn/...