十二大信號(hào)通路概述 MAPK信號(hào)通路 Notch信號(hào)通路 PI3K/ALK信號(hào)通路 Hippo信號(hào)通路 RTK相關(guān)信號(hào)通路 Hedgehog信號(hào)通路...
IP屬地：福建
-
十二大經(jīng)典信號(hào)通路概述
-
基因ID轉(zhuǎn)換方法總結(jié)1. clusterProfiler包，bitr()轉(zhuǎn)換ID函數(shù) clusterProfiler 是Y叔寫(xiě)的一個(gè)功能強(qiáng)大的R包，可以用來(lái)做各種富集分析，如GO、KEGG、DO...
-
2021-07-17 MAPK/ERK通路簡(jiǎn)介有絲分裂原激活的蛋白激酶(MAPK)是在真核生物中非常保守的絲/蘇氨酸蛋白激酶，在生長(zhǎng)增殖，細(xì)胞分化，細(xì)胞運(yùn)動(dòng)或死亡等細(xì)胞活動(dòng)中發(fā)揮重要的調(diào)控作用。MAPK級(jí)聯(lián)信號(hào)傳導(dǎo)由3 ...
-
數(shù)據(jù)可視化的常用在線圖表工具推薦想要通過(guò)數(shù)據(jù)得到美觀的圖表，除了基礎(chǔ)版的excel，專業(yè)版的Power BI和Tableau、技術(shù)版的python-matplotlib庫(kù)，R語(yǔ)言等等，還有一些比基礎(chǔ)版較為高...
-
2021-07-31 細(xì)胞焦亡程序性細(xì)胞死亡(Programmed Cell Death, PCD)，是指細(xì)胞接受某種信號(hào)或受到某些因素刺激后，為了維持內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定而發(fā)生的一種主動(dòng)性消亡過(guò)程。凋亡、自噬、細(xì)...
-
TCGA 數(shù)據(jù)下載分析利器 —— TCGAbiolinks（一）前言 TCGAbiolinks 是一個(gè)利用 GDC API 接口來(lái)查詢、下載和分析 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)的 R 包 TCGAbiolinks 包的功能主要可以分為三大塊： ...
-
單細(xì)胞筆記1-Seurat標(biāo)準(zhǔn)流程
加載數(shù)據(jù)集 pbmc.data <- Read10X(data.dir = "../data/pbmc3k/filtered_gene_bc_matrices/hg19/")...
-
快捷查找KEGG里的通路和基因
需求 1.快捷查找ID對(duì)應(yīng)的description，知道通路對(duì)應(yīng)的編號(hào)是多少。2.找出某一個(gè)/幾個(gè)通路里的全部基因，用來(lái)做單獨(dú)的下游分析。 如果是要做KEGG的富集分析，cl...
-
2021-04-16 泛素-蛋白酶體途徑泛素 泛素(ubiquitin，UB)是一類含76個(gè)氨基酸、大小約為8.6 kDa的小蛋白質(zhì)，在真核生物中普遍存在且高度保守。人類基因組中有四個(gè)基因編碼泛素的基因：UBB，U...
-
值得收藏——10個(gè)蛋白結(jié)構(gòu)分析預(yù)測(cè)和相關(guān)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)站上期小編給大家介紹了疾病與基因突變相關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)，今天小編為大家介紹幾個(gè)與基因產(chǎn)物——蛋白質(zhì)相關(guān)的幾個(gè)網(wǎng)站，希望對(duì)大家有所幫助，感興趣的小伙伴可以收藏起來(lái)，也歡迎點(diǎn)贊和關(guān)注哦！...
-
NetPhos 3.1--蛋白磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)蛋白磷酸化修飾：蛋白磷酸化是一種非常普遍存在的翻譯后修飾（Protein post-translational modification，PTM）的一種類型。蛋白質(zhì)的磷酸化是...
-
SCENIC單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子分析介紹及操作| 1. 簡(jiǎn)介 SCENIC[http://www.360doc.com/content/21/0322/18/15690396_968318453.shtml]（singl...
-
10 靶點(diǎn)預(yù)測(cè)跟著學(xué)長(zhǎng)學(xué)習(xí)了一些靶點(diǎn)預(yù)測(cè)的方法，主要使用到的工具有以下兩種 瑞士靶點(diǎn)預(yù)測(cè)：http://www.swisstargetprediction.ch/index.php[htt...
-
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序1-測(cè)序原始數(shù)據(jù)說(shuō)明
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是最常用的組學(xué)實(shí)驗(yàn)，對(duì)全譜基因定量，找到差異表達(dá)基因。RNAseq涉及到原始數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)質(zhì)控，基因組比對(duì)，差異基因鑒定，差異基因功能富集分析，重要基因如轉(zhuǎn)錄因子激酶的...
-
數(shù)據(jù)挖掘20210114學(xué)習(xí)筆記GEO數(shù)據(jù)挖掘 圖表介紹 1.熱圖 ·輸入數(shù)據(jù)是數(shù)值型矩陣\數(shù)據(jù)框·顏色的變化表示熟知的大小 2.散點(diǎn)圖和箱線圖 箱線圖：輸入數(shù)據(jù)是一個(gè)數(shù)值型向量和一個(gè)字符串向量（重復(fù)值）箱...
-
交集展示——韋恩圖與集合圖對(duì)于集合的可視化，第一時(shí)間想到的都是韋恩圖（venn diagram），一般集合不超過(guò)5個(gè)的時(shí)候，可視化效果還是不錯(cuò)的;但是一旦數(shù)據(jù)集增加，比如說(shuō)五個(gè)的時(shí)候，你就很難從圖中解...
-
GEO數(shù)據(jù)挖掘?qū)W習(xí)筆記二
學(xué)習(xí)教程來(lái)源于《手把手教你GEO數(shù)據(jù)庫(kù)差異基因分析》 本次學(xué)習(xí)筆記內(nèi)容為通過(guò)GEO2R在線工具進(jìn)行差異基因分析 通過(guò)了解，個(gè)人覺(jué)得這個(gè)方法相比R語(yǔ)言的優(yōu)勢(shì)是更普適性，以及更加...