每天持續(xù)更新，感謝你的的關(guān)注和點贊分享Python、數(shù)據(jù)分析、可視化、Excel、爬蟲。<br>本人B站視頻號：Python與數(shù)據(jù)分析_青青<br><br><br>關(guān)注我 <br> ↓
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測序深度和測序覆蓋度，怎么估算？在我們開始測序之前，經(jīng)常會被問道，你需要的測序深度和測序覆蓋度的概念，比如在測序線粒體的DNA時候，測序小哥就問說1個G的數(shù)據(jù)量夠了嗎？下面就給大家解釋下這兩個概念： 測...
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單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的跨物種分析文章信息 作者信息 摘要： 使用scRNA測序分析成千上萬個單細胞的能力徹底改變了細胞和發(fā)育生物學領(lǐng)域，為跨許多物種的細胞類型和功能的多樣性提供了令人難以置信的見解。這些技術(shù)...
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基因相關(guān)性的計算在單細胞轉(zhuǎn)錄組解析肥厚性心肌病發(fā)病機制[http://www.itdecent.cn/p/f270b9431427]里面看到計算某基因與其它基因的相關(guān)性 方法里寫的是這樣做...
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單細胞軌跡分析之應用篇作者，Evil Genius 最近見到了很多研究者，真的是不把單細胞軌跡分析當回事，拿到樣本不定義直接跑monocle，這能對么？我看了都著急，基本理論要多多學習啊~~~，網(wǎng)...
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超全總結(jié)--單細胞+空間轉(zhuǎn)錄組的整合分析方法總結(jié)這一篇我們做一個詳細的總結(jié)，周五了，疫情還沒結(jié)束，父母也都老了，有時候真的感覺身為兒子實在不孝，常年在外，回家很少，家里有點事父母也不會跟我這個兒子說，小病小災的也舍不得去醫(yī)...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組的注釋流派作者，追風少年i~ 高考第二天，去看了一下在今天高考的數(shù)學卷子，驚奇的發(fā)現(xiàn)最后的壓軸題自己還會做，?? ，大家不妨試一試，題在下面 以前學數(shù)學的時候總是覺得生活中根本用不到，買...
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10X單細胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）原始數(shù)據(jù)真的是zero-inflated分布？今天我們來將一個數(shù)據(jù)分布的情況，接觸10X單細胞或者10X空間轉(zhuǎn)錄組不久之后，就認識到了一些數(shù)據(jù)的特征，比如經(jīng)常提到的dropout/missing data/zero-in...
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NGS原理- 單細胞轉(zhuǎn)錄組測序-介紹CEL-seq2, Drop-seq, SCRBseq, Smart-seq
轉(zhuǎn)載自https://www.plob.org/article/9429.html 導讀 在單細胞研究的大潮中，新的測序方法層出不窮。不過，很少有人對這些方法進行系統(tǒng)的比對。...
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DSP(Digital Spatial Profiler)空間轉(zhuǎn)錄組與單細胞數(shù)據(jù)聯(lián)合分析之cell2location這一篇繼續(xù)回顧一下cell2location，使用我們推薦用于基于探針的空間轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)的 cell2location 方法的一個版本，將胎兒腦細胞類型映射到使用 Nanos...
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10X單細胞空間聯(lián)合分析之cell2location的詳細梳理又是周五，馬上元旦，不知道大家打算怎么跨年呢？但是，今天還是工作日，我們還是要學習學習，不負韶華。 這一篇還是想詳細梳理一下cell2location，包括算法以及代碼的寫法...
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10X單細胞空間個性化回顧總結(jié)這一篇，我們繼續(xù)總結(jié)，這里用到的PPT是我給產(chǎn)品技術(shù)培訓用的PPT，當然了，有一些內(nèi)容一筆帶過，有的地方詳細講了講，免費分享給大家，祝愿大家科研順利，喜歡生物信息的，喜歡單細...
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10X單細胞空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析之DAVAE隔離的第10天，孤獨仍在，且行且珍惜，每個人都會做一些選擇，選擇之后，珍惜眼前人。好了，今天我們分享的方法是10X單細胞、10XATAC、10X空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析相互之間的聯(lián)...
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人類肝臟的單細胞、單核和空間 RNA 測序可識別膽管細胞和間充質(zhì)異質(zhì)性hello，周二了，隔離的第二天，一個人的日子總是難熬，耐得住寂寞的人，都成了圣人~~~，今天我們分享的文獻在Single-Cell, Single-Nucleus, and...
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10X單細胞空間數(shù)據(jù)分析之表征細胞狀態(tài)和生態(tài)型（EcoTyper）隔離的第三天，一個人的日子總是很難熬，沒辦法，孤獨總是常伴我身，今天我們分享的文獻在Atlas of clinically distinct cell states and ...
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Nature Reviews Genetics| 在基因組學中應用機器學習的常見陷阱Nature Reviews Genetics| 在基因組學中應用機器學習的常見陷阱 Whalen, S., Schreiber, J., Noble, W.S. et al...
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R語言入門--第九節(jié)（功效分析）功效分析是在實驗設(shè)計籌備階段進行的分析手段。一般用于求達到目標顯著性水平與功效（把握），求所需樣本量；或者給定樣本量，實驗有多大的把握做出判斷。 0、基礎(chǔ)四要素 樣本大小：每...
