發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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我只是知識的搬運工~
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測序有關問題
1.為什么要在上機測序之前做PCR擴增？ 測到的reads數(shù)取決于flowcell上長了多少cluster（1個模板鏈擴增出一簇分子），有多少cluster，理論上就得到多少...
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北京基因組所研究生在讀，實驗&生信小蝸牛一只。歡迎一起討論呀~ <br>liulinli17m@big.ac.cn
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DiseaseMeth 人類疾病相關的甲基化信息數(shù)據(jù)庫
DNA甲基化作為表觀遺傳的一種標記，在生長發(fā)育和疾病發(fā)生過程中扮演著重要角色。隨著大規(guī)模甲基化研究的進行，積累了大量疾病相關的甲基化數(shù)據(jù)，DiseaseMeth就是一個保存了...
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iMETHYL : 整合了DNA甲基化, SNP和RNA_seq的多組學聯(lián)合數(shù)據(jù)庫
在NGS飛速發(fā)展的時代，有大量研究通過GSWA的方法，闡述了SNP于疾病之間的關聯(lián); 也有學者利用WGBS，RRBS, 甲基化芯片等方式研究DNA甲基化與疾病之間的關系。不過...
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MethyCancer : 癌癥相關的甲基化基因數(shù)據(jù)庫
癌癥作為人類健康的頭號殺手，引起了科研工作者的官方關注。鑒于DNA甲基化修飾在腫瘤中的重要作用， MethyCancer數(shù)據(jù)庫整合了DNA甲基化數(shù)據(jù)和基因表達譜數(shù)據(jù)，將癌癥與...
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MethHC: 整合了癌癥相關的甲基化與基因表達譜數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫
在MethHC數(shù)據(jù)庫中，提供了18種癌癥相關的DNA甲基化，microRNA表達譜和基因表達譜的數(shù)據(jù)，這里的數(shù)據(jù)來源于TCGA數(shù)據(jù)庫。同時采用線性回歸的方法計算甲基化和表達譜...
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NGS - Alignment 序列對比Introduction Resequencing 重測序 [NIBI] Resequencinghttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/probe/doc...
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用泊松分布解釋 NGS 測序數(shù)據(jù)的 duplication 問題
tags： NGS duplication 不管從哪個角度看我們都希望測序儀產出的數(shù)據(jù)中 duplicate 率盡量低。怎樣降低 duplicate 率？ 構建文庫時，核酸提...
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NGS-概念解釋+測序過程對二代基因測序的有些概念還是不太清楚 Illumina 平臺 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3178052/The...
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NGS 數(shù)據(jù)過濾之 Trimmomatic 詳細說明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過濾對后續(xù)分析至關重要，去除一些無用的序列也可以提高后續(xù)分析的準確率和效率。Trimmomatic 是...
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NGS的臨床應用（二）近日在 Archives of Pathology & Laboratory Medicine 雜志上發(fā)表了一篇題為Review of Clinical Next-Gener...
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NGS的臨床應用（一）近日在 Archives of Pathology & Laboratory Medicine 雜志上發(fā)表了一篇題為Review of Clinical Next-Gener...
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分析記錄 | 差異分析和KEGG GO物種Verticillium dahliae Kleb 1.deseq2差異分析 只有count數(shù)據(jù)。按照count數(shù)據(jù)建立col data表格。 因為col data表格只...
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Sanger 測序，NGS 測序，數(shù)據(jù)分析
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