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用clusterProfiler做GSEA（一）GSEA的介紹：https://www.omicsclass.com/article/230GSEA有相應(yīng)的軟件，其實(shí)clusterProfiler除了做go term 富集...
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仰望星空，腳踏實(shí)地
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R繪制維恩圖 —— ggvenn韋恩圖，Venn diagram，常用圖的一種，用來展示集合之間的特異性和共同性?，F(xiàn)在有很多在線的網(wǎng)站都可以繪制，但是R來畫也方便，其中g(shù)gvenn是基于ggplot2的專門...
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AUCell：計(jì)算單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的每個(gè)細(xì)胞中特定基因集的活性程度AUC允許在單細(xì)胞rna數(shù)據(jù)集中識(shí)別具有活性基因集（如gene signature,gene module）的細(xì)胞。AUCell使用曲線下面積來計(jì)算輸入基因集的一個(gè)關(guān)鍵子集是...
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從GO數(shù)據(jù)庫找基因集合做AUCellAUCell 1.提取指定GOterm的基因 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7606976/[https://ww...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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分子模擬和基因組學(xué)大雜燴，我們是生物信息愛好者，開源，共享盡在生信雜談~ 請(qǐng)關(guān)注微信公眾號(hào)生信雜談（xiaoddrz）獲取更多原創(chuàng)精彩內(nèi)容！<br>若您只是做基因的可以通過右側(cè)文集篩選文章
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WGCNA實(shí)例分析及解讀（附代碼）WGCNA分析基于兩個(gè)假設(shè)：1.相似表達(dá)模式的基因可能存在共調(diào)控、功能相關(guān)或處于同一通路，2.基因網(wǎng)絡(luò)符合無尺度分布?；谶@兩點(diǎn)，可以將基因網(wǎng)絡(luò)根據(jù)表達(dá)相似性劃分為不同的模塊...
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單細(xì)胞分析之細(xì)胞通訊：cellchat這篇文章在2020年7月上傳到了bioRxiv（Inference and analysis of cell-cell communication using CellCha...
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這個(gè)世界流行離開，但我們卻不擅長告別
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不看私信<br>看不到的文章是被簡書鎖了
