GSEA的介紹:https://www.omicsclass.com/article/230GSEA有相應的軟件,其實clusterProfiler除了做go term 富集...
韋恩圖,Venn diagram,常用圖的一種,用來展示集合之間的特異性和共同性。現(xiàn)在有很多在線的網(wǎng)站都可以繪制,但是R來畫也方便,其中ggvenn是基于ggplot2的專門...
AUC允許在單細胞rna數(shù)據(jù)集中識別具有活性基因集(如gene signature,gene module)的細胞。AUCell使用曲線下面積來計算輸入基因集的一個關鍵子集是...
AUCell 1.提取指定GOterm的基因 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7606976/[https://ww...
WGCNA分析基于兩個假設:1.相似表達模式的基因可能存在共調(diào)控、功能相關或處于同一通路,2.基因網(wǎng)絡符合無尺度分布。基于這兩點,可以將基因網(wǎng)絡根據(jù)表達相似性劃分為不同的模塊...
這篇文章在2020年7月上傳到了bioRxiv(Inference and analysis of cell-cell communication using CellCha...