上海唯那生物專(zhuān)注于微生物科研，密碼子學(xué)院平臺(tái)分享了數(shù)十套微生物生信和實(shí)驗(yàn)操作課程，搜索【密碼子學(xué)院】學(xué)習(xí)課程。
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生物學(xué)數(shù)據(jù)分析
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札記分享：生物信息學(xué)，統(tǒng)計(jì)學(xué)，算法。。。。。。
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在線工具網(wǎng)站，生物分析的一些網(wǎng)站或者數(shù)據(jù)庫(kù)之類(lèi)的文章。??相關(guān)的文章會(huì)在收錄時(shí)間上相近，請(qǐng)點(diǎn)擊『最新收錄』 ?????????????????????????? ?? 數(shù)據(jù)庫(kù)，比如Ensembl、Phytome ?? 癌癥分析網(wǎng)站，比如GEPIA、cBioportal ?? 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的美化，比如iTOL ?? 基因注釋?zhuān)热鏜etascape、KASS ?? 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)，比如pfam、SMART ?? 在線繪制統(tǒng)計(jì)圖，比如Venny ?? 序列比對(duì)，比如blast ?? 引物設(shè)計(jì)，比如primer3、primer-blast ?? 文獻(xiàn)下載，比如sci-hub，文獻(xiàn)鳥(niǎo) ?? 。。。
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個(gè)人學(xué)習(xí)生信的一點(diǎn)心得 歡迎討論指摘
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生物信息學(xué)（Bioinformatics）是一門(mén)交叉科學(xué)，它包含了生物信息的獲取、加工、存儲(chǔ)、分配、分析、解釋等在內(nèi)的所有方面，它綜合運(yùn)用數(shù)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和生物學(xué)的各種工具，來(lái)闡明和理解大量生物數(shù)據(jù)所包含的生物學(xué)意義。它隨1990年人類(lèi)基因組計(jì)劃（HGP）的實(shí)施和信息技術(shù)的發(fā)展而誕生，現(xiàn)已迅速發(fā)展成為當(dāng)今生命科學(xué)最具吸引力和重大的前沿領(lǐng)域，為生物學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)、信息科學(xué)等專(zhuān)業(yè)的高素質(zhì)人才提供了更廣闊的發(fā)展天地
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生信必備生物知識(shí)
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記錄數(shù)據(jù)分析過(guò)程中遇到的那些讓我漲知識(shí)的坑，生信札記
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生信學(xué)習(xí)筆記、腳本編程、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)分析 ～～～ 生物信息領(lǐng)域的大雜燴～ 好大一鍋亂燉，快到我的額碗里來(lái)～ 好好學(xué)習(xí)，天天學(xué)生信～
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章。感謝這些簡(jiǎn)友整理的生信分析流程！ 如果簡(jiǎn)友投稿沒(méi)有被我收入專(zhuān)題，可能是我沒(méi)看到或者收入到其他針對(duì)性更強(qiáng)的專(zhuān)題中了。望見(jiàn)諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時(shí)候請(qǐng)點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看。 ?? 全基因組測(cè)序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測(cè)序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過(guò)程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過(guò)程 ?? 數(shù)據(jù)庫(kù)的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來(lái)的流程 ?? ?? ??
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生物信息學(xué)軟件，perl、python、R、shell腳本交流分享
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生信技能樹(shù)：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公眾號(hào)：優(yōu)雅R 生物數(shù)據(jù)分析QA，技術(shù)文檔與博客，需要你的參與。 ……………………………… 歡迎在簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作和做筆記的生信學(xué)習(xí)者、愛(ài)好者以及相關(guān)編程人員加入本專(zhuān)題，貢獻(xiàn)你的文字，無(wú)論是原創(chuàng)還是筆記，我們需要你，將本專(zhuān)題打造為生信知識(shí)寶庫(kù)、交流平臺(tái)。 內(nèi)容可以是對(duì)生物信息學(xué)與算法知識(shí)相關(guān)資源的收集、整理，以及原創(chuàng)筆記： * R * Python * Perl * Linux 工具與編程 * 繪圖 * 統(tǒng)計(jì) * 計(jì)算生物學(xué) * 各類(lèi)算法 * 機(jī)器學(xué)習(xí)
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