我們生活著的世界并非只有我們自己,而是有很多小于或大于我們的生物不斷與我們交互著,有的讓我們開心,有的使我們傷心。這就關(guān)系到一個本質(zhì)的問題: 我是誰? 我是一個腦袋,一個軀體...
一、樣品處理 1.1 Q:包埋過程應(yīng)遵從什么原則?A: (1) 選取的組織要大小合適,便于后續(xù)實驗操作。 (2) 取的組織要盡量新鮮,避免RNA降解。 (3) 選用合適的包埋...
更多內(nèi)容請關(guān)注個人公眾號---KS科研分享與服務(wù)---接上節(jié)(跟著Cell學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析(三):單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)控(QC)及合并去除批次效應(yīng)[http://mp.wei...
按:RNA-seq 流程非常多樣化,每一個步驟可選工具都非常多。我的選擇是 StringTie 進(jìn)行組裝取得 read counts 數(shù)值,DESeq2 分析差異基因。這里把...
以前寫過不少零散的 RNA-Seq 分析文章,現(xiàn)在整理為流程,同時修改一些錯誤。流程包含質(zhì)控、比對、定量、差異分析。 前處理 拿到原始 fastq 數(shù)據(jù)先進(jìn)行前處理。前處理包...