The genetic causes of convergent evolution[https://www.nature.com/articles/nrg3483] 要點 ...
RevBayes[https://revbayes.github.io/tutorials/divrate/ebd.html]需要進一步的研究 使用BAMM估算分化速率[ht...
前段時間,接了老師一個等位基因特異性表達的任務,前后再加上其他的分析帶著做,再捋流程,拖拖拉拉也用了小一個月,終于從原始測序數(shù)據(jù),得到了最終的那張table,具體的內(nèi)容基本已...
當下的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中,每年都會遭受來自生物或非生物脅迫帶來的損失。想要挽回損失,進行作物抗性育種,就迫切需要理解植物對于外界脅迫的響應。植物細胞內(nèi)NLR蛋白是一類識別病原微生物效...
1 NLR pair定義 NLR pair(NLR 功能對),是在染色體上有著明顯“頭對頭”排列特征,兩個基因協(xié)同調(diào)控免疫反應,其中起識別效應蛋白作用的基因稱為Sensor,...
對于多基因組CRE鑒定,文獻給予了方法, To identify orthologues of the 52,169 sugar glider candidate cis-r...
-2. 在一篇講泥炭蘚的MBE看到了dfoil的使用 《Extensive Genome-Wide Phylogenetic Discordance Is Due to In...
最近看到的一些T2T補gap軟件軟件: softwareDownloadTimeArticleJournalquarTeThttps://github.com/aaranyu...
fasta格式是一種基于文本用于表示核酸序列或多肽[https://baike.baidu.com/item/%E5%A4%9A%E8%82%BD/1511295?fromM...
odgi 把GFA文件按染色體拆分 odgi 提取PGGB泛基因組子圖 gfabase 提取MC泛基因組子圖 坐標系轉(zhuǎn)換 gfa 有路徑信息和Node信息,有時候為了研究需要...
Mycoheterotrophs(真菌異養(yǎng)型植物):植物和真菌的共生大概開始于450百萬年前。真菌異養(yǎng)是一種特殊的植物-真菌共生類型,植物從共生真菌獲得固定碳和其他營養(yǎng)物質(zhì),...
if [ -f "./env.sh" ]; then source ./env.sh else echo "env.sh file not in current direct...
有一個問題,就是orthofinder找到的單拷貝太少了,有木有什么方法把多拷貝種相似度最高的挑選出來作為單拷貝呢
比較基因組學分析1:構(gòu)建單拷貝基因樹比較基因組學分析目錄 1:單拷貝基因構(gòu)建物種樹以及計算分化時間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2:基因家族收縮與擴張分析[ht...
農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化技術(shù)是指將目的基因插入到經(jīng)過改造的T-DNA區(qū),借助農(nóng)桿菌的感染實現(xiàn)外源基因向植物細胞的轉(zhuǎn)移與整合,然后通過細胞和組織培養(yǎng)技術(shù),再生出轉(zhuǎn)基因植株的技術(shù)。 Ti ...
1. RNAseq回帖到CDS序列 2. 2代數(shù)據(jù)回帖到基因組序列 將對應的cds/rna.bam和gene_genome.fa/gene_genome.bam拖入到geni...