您好，請(qǐng)問(wèn)您知道這個(gè)高亮基因的顏色該怎么修改了嗎，麻煩您，希望得到您的幫助
零基礎(chǔ)多物種間共線性分析首先非常感謝Cj大神開(kāi)發(fā)出來(lái)的TBtools生信工具，為生信分析做圖帶來(lái)了極大的便利。作為生信小白，在做多物種間共線性分析時(shí)，嘗試了多種方法，苦于沒(méi)有計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)，一直沒(méi)能完成...
首先非常感謝Cj大神開(kāi)發(fā)出來(lái)的TBtools生信工具，為生信分析做圖帶來(lái)了極大的便利。作為生信小白，在做多物種間共線性分析時(shí)，嘗試了多種方法，苦于沒(méi)有計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)，一直沒(méi)能完成...
寫在前面 對(duì)于沒(méi)有做過(guò)共線性分析的小伙伴，可以通過(guò)以下幾段內(nèi)容，了解一下，我為什么要費(fèi)勁巴拉畫(huà)出這樣一張圖。 除了基因組成的相似性,在不同基因組中基因排列順序的一致性更能夠體...
文獻(xiàn)：REVIGO Summarizes and Visualizes Long Lists of Gene Ontology Terms 發(fā)表年份：Received Mar...
全文分析流程學(xué)習(xí)按照：九月學(xué)徒ChIP-seq學(xué)習(xí)成果展 一、 怎么將SAR文件轉(zhuǎn)為fastq文件？ 1. 【方法】利用軟件sratoolkit，下載后解壓，找到其中的 f...
前期的到的基因表達(dá)量矩陣，可以得到每個(gè)基因的表達(dá)量，然而由于我們?cè)谧鰧?shí)驗(yàn)過(guò)程中的重復(fù)（包括技術(shù)重復(fù)與生物學(xué)重復(fù)）理論上來(lái)講是可以保持表達(dá)量在重復(fù)中的一致性。因此我們也可通過(guò)這...
今天是不用學(xué)代碼利用生信軟件聯(lián)合“點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)”就可以取得hub基因的“白癡”實(shí)操，趕快點(diǎn)起來(lái)～ Hub基因（關(guān)鍵基因）是在生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮重要作用的基因，它往往在通路中為主導(dǎo)地位...
之前有一次，我導(dǎo)說(shuō)“能不能把這些基因按順序畫(huà)在果蠅的染色體上”，因此，我尋找了一些實(shí)現(xiàn)這個(gè)需求的方法。經(jīng)過(guò)一番奇奇怪怪的操作之后，最終用ggplot2畫(huà)了。。。其它方法簡(jiǎn)單地...
需求：下載DNA損傷修復(fù)相關(guān)的基因列表。 第一步 搜索數(shù)據(jù)庫(kù) 進(jìn)入GO (Gene Ontology) 數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)頁(yè) http://geneontology.org/ ，在搜索...
首先聲明，作為大學(xué)時(shí)的生物狗和工作時(shí)的挨踢狗，實(shí)非基因測(cè)序的專業(yè)人士。 再說(shuō)說(shuō)寫這篇文章的緣由，華大基因的BGISEQ-500?，自從15年10月發(fā)布會(huì)以來(lái)，就鮮有報(bào)道，但作...
01 什么是全基因組復(fù)制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/復(fù)制（whole genome duplication, WGD）事件是指基因組內(nèi)的所有序列都發(fā)生重復(fù)，...
放一張效果圖，這些，三四年前的東西，我其實(shí)一直懶得說(shuō)。 寫在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個(gè)功能可以說(shuō)，也是一時(shí)興起寫出來(lái)的。開(kāi)發(fā)的...
前言：進(jìn)行RNA-seq入門實(shí)戰(zhàn)首先需要有一定的linux與R基礎(chǔ)，推薦跟著B(niǎo)站生信技能樹(shù)-jimmy老師學(xué)習(xí)打牢基礎(chǔ)：【生信技能樹(shù)】生信人應(yīng)該這樣學(xué)linux(更新至第14...
測(cè)序行業(yè)的蓬勃發(fā)展，帶來(lái)微生物組學(xué)日新月異的變化。目前，單一組學(xué)的文章不斷“貶值”，前沿研究的目光從單一組學(xué)逐步拓展至多組學(xué)對(duì)貫穿分析，即結(jié)合多個(gè)組學(xué)的分析角度，從多個(gè)層面闡...
1、fastq文件 一般我們從公司里得到的原始測(cè)序數(shù)據(jù)都是屬于fastq.gz文件, .gz是一種壓縮格式的縮寫，于是首先第一步是對(duì)這些壓縮格式進(jìn)行解壓操作 解壓好的文件即正...
上次分享我們通過(guò)兩種方式下載得到了SRA數(shù)據(jù)，今天就開(kāi)始對(duì)SRA進(jìn)行處理（以SRR5489805為例）。SRA（Sequence ReadArchive）數(shù)據(jù)庫(kù)是用于存儲(chǔ)二代...
