安裝PopLDdecay時報錯1.使用conda 安裝 但是這么安裝的時候~/miniconda3/envs/PopLDdecay/bin路徑下只有PopLDdecay程序,...
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-2. 僅作筆記,僅介紹軟件的使用,不涉及原理 -1. 使用的是SNP的數(shù)據(jù)/vcf文件 https://github.com/DReichLab/AdmixTools 0....
最近看了一篇綜述,粗略翻譯一下文獻(xiàn):Padhukasahasram, B. (2014). Inferring ancestry from population genomi...
當(dāng)在Linux命令行中操作時,以下是一些常用的光標(biāo)操作技巧:移動光標(biāo)到行首:Ctrl + a移動光標(biāo)到行尾:Ctrl + e移動光標(biāo)到上一個單詞的開頭:Ctrl + ←移動光...
這篇文章主要是介紹繪制進(jìn)化樹用的ggtree以及一些拓展包的基礎(chǔ)用法,因為gg系列繪圖的邏輯基本是搭積木,這種介紹性的文章能夠幫助快速的找到想要的“積木”以及拼接的方法,剩下...
單倍型,是單倍體[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的簡稱,在遺傳學(xué)上是指...
目錄 前言[http://www.itdecent.cn/p/729673778e43] 方法簡介[http://www.itdecent.cn/p/d9bd081763...
不好意思,我沒有報過這個錯,不過你可以檢查seqid和layout文件,這兩個文件不要在Windows系統(tǒng)生成,你直接在linux系統(tǒng)中復(fù)制粘貼。
[比較基因組] 共線性分析(jcvi)jcvi軟件的使用 官網(wǎng)[https://github.com/tanghaibao/jcvi/issues/300] 軟件下載 3 測試數(shù)據(jù)下載(下載前去Phytozome...
此視頻來自B站,是非常好和全的的一個GWAS操作的視頻,從開始準(zhǔn)備軟件下載,數(shù)據(jù)過濾,到最后的候選基因注釋。GWAS的實戰(zhàn)視頻https://www.bilibili.com...
R包版本首先使用conda下載devtools 進(jìn)入R并使用devtools下載pophelper 如圖 成功安裝pophelper包 還不成功的話,可以直接用conda安裝...
在服務(wù)器上經(jīng)常遇到需要安裝某個軟件包的時候發(fā)現(xiàn)需要root權(quán)限才可以執(zhí)行編譯以進(jìn)行安裝。那么除了向管理員申請superuser的權(quán)限這樣比較麻煩的處理以外就需要掌握如何在沒有...
寫在前面:我對建樹也是一知半解,這里只是想記錄一下自己跟別人學(xué)習(xí)的建樹方法,可能不具有普適性。但畢竟寫在公眾平臺,大家選擇性參考。 主要的步驟包括用jModelTest來選擇...
關(guān)于該軟件的計算可選參數(shù)以及結(jié)果文件的解讀,見前三篇分享: 序列比對軟件 MUMmer 快速上手(一)[http://www.itdecent.cn/writer#/not...