1. 官網(wǎng)查看版本,因為7.2.0兼容低通量的數(shù)據(jù),所以決定安裝7.2.0 2. 按照個人習(xí)慣,網(wǎng)上搜安裝帖子,出現(xiàn)兩個問題 1)wget 下載報錯,可能是因為鏈接權(quán)限的...
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#保存文件 write.table(final_gene$Var1,paste0(pro,"_gene_v2.txt",sep = ",",quote = F,row.nam...
??作為生命科學(xué)的從事者,不論是老師或者學(xué)生都應(yīng)該用過NCBI((National Center for Biotechnology Information Search d...
按照官網(wǎng)教程安裝CeleScope: 出現(xiàn)各種 Cython.Compiler.Errors.CompileError: 以及 note: This error origin...
一、ScaleData()簡介 單細胞基因表達counts矩陣數(shù)據(jù)經(jīng)過NormalizeData()歸一化處理后,還需要進行scale標準化。ScaleData()[http...
本次筆記內(nèi)容:fill =的位置: ggplot(aes(fill = )) & geom_boxplot(fill = ) & geom_boxplot(aes(fill ...
@(Dayueban)[靶向|非靶向|代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析] 導(dǎo)讀 如今組學(xué)數(shù)據(jù)的產(chǎn)出量日益龐大。代謝組學(xué)數(shù)據(jù)也是如此,隨著科技的創(chuàng)新和技術(shù)的變革,允許科研工作者們通過大樣本數(shù)據(jù)...
由于太久沒有分析過bulk數(shù)據(jù)了,前幾天突然被要求分析一個文章的數(shù)據(jù)時有點亂了手腳,所以在這里想總結(jié)一下關(guān)于芯片數(shù)據(jù)與seq數(shù)據(jù)的差異分析流程。 假如你是小白,也剛剛了解NG...
軌跡分析系列: 單細胞之軌跡分析-1:RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析(Pseudot...
關(guān)于 pheatmap 作圖時的報錯 作圖時,顏色向量沒有和注釋數(shù)據(jù)框里的向量作匹配(偷懶),所以出現(xiàn)以下報錯,解決辦法:指定每個顏色對應(yīng)的名稱。 aa <- unique(...
在諸如:ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq(m6A)、Cut&Tag中我們常常聽到一個詞Call Peak。Call Peak究竟是什么東西,得到的結(jié)果又...
1.R程序并行運算和調(diào)整R內(nèi)部允許的對象大小的限制 默認是500 * 1024 ^ 2 = 500 Mb future在seurat的具體應(yīng)用詳見:https://satij...
1. Seurat對象查看當前的Assay 在進行了SCTransform操作后,矩陣默認會變成SCT矩陣,如果不加設(shè)置,后續(xù)的PCA等操作都是基于SCT矩陣。修改Defau...
ggpubr: 'ggplot2' Based Publication Ready Plots 一款基于ggplot2的可視化包ggpubr,能夠一行命令繪制出符合出版物要求...